Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIGMAR1Q99720 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGMAR1Q99720 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIGMAR1Q99720 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1Q99720 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIGMAR1Q99720 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIGMAR1Q99720 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIGMAR1Q99720 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGMAR1Q99720 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGMAR1Q99720 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIGMAR1Q99720 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIGMAR1Q99720 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIGMAR1Q99720 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIGMAR1Q99720 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGMAR1Q99720 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGMAR1Q99720 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGMAR1Q99720 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIGMAR1Q99720 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIGMAR1Q99720 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIGMAR1Q99720 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIGMAR1Q99720 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIGMAR1Q99720 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIGMAR1Q99720 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIGMAR1Q99720 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIGMAR1Q99720 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIGMAR1Q99720 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SIGMAR1Q99720 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIGMAR1Q99720 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SIGMAR1Q99720 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIGMAR1Q99720 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIGMAR1Q99720 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIGMAR1Q99720 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIGMAR1Q99720 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIGMAR1Q99720 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SIGMAR1Q99720 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIGMAR1Q99720 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIGMAR1Q99720 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SIGMAR1Q99720 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SIGMAR1Q99720 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SIGMAR1Q99720 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIGMAR1Q99720 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIGMAR1Q99720 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIGMAR1Q99720 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIGMAR1Q99720 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIGMAR1Q99720 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIGMAR1Q99720 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SIGMAR1Q99720 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIGMAR1Q99720 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIGMAR1Q99720 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIGMAR1Q99720 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIGMAR1Q99720 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1Q99720 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIGMAR1Q99720 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1Q99720 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIGMAR1Q99720 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIGMAR1Q99720 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIGMAR1Q99720 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIGMAR1Q99720 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIGMAR1Q99720 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIGMAR1Q99720 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIGMAR1Q99720 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIGMAR1Q99720 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIGMAR1Q99720 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIGMAR1Q99720 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIGMAR1Q99720 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIGMAR1Q99720 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIGMAR1Q99720 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIGMAR1Q99720 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIGMAR1Q99720 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIGMAR1Q99720 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIGMAR1Q99720 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIGMAR1Q99720 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SIGMAR1Q99720 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIGMAR1Q99720 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIGMAR1Q99720 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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