Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DCHS1Q96JQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.05
DCHS1Q96JQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DCHS1Q96JQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DCHS1Q96JQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCHS1Q96JQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DCHS1Q96JQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DCHS1Q96JQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DCHS1Q96JQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DCHS1Q96JQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DCHS1Q96JQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DCHS1Q96JQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DCHS1Q96JQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DCHS1Q96JQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DCHS1Q96JQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DCHS1Q96JQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCHS1Q96JQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
DCHS1Q96JQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
DCHS1Q96JQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
DCHS1Q96JQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DCHS1Q96JQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DCHS1Q96JQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DCHS1Q96JQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DCHS1Q96JQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DCHS1Q96JQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
DCHS1Q96JQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DCHS1Q96JQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DCHS1Q96JQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DCHS1Q96JQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
DCHS1Q96JQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DCHS1Q96JQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
DCHS1Q96JQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DCHS1Q96JQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
DCHS1Q96JQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DCHS1Q96JQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DCHS1Q96JQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DCHS1Q96JQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DCHS1Q96JQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DCHS1Q96JQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DCHS1Q96JQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DCHS1Q96JQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DCHS1Q96JQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DCHS1Q96JQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
DCHS1Q96JQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DCHS1Q96JQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DCHS1Q96JQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DCHS1Q96JQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DCHS1Q96JQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DCHS1Q96JQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DCHS1Q96JQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DCHS1Q96JQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DCHS1Q96JQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DCHS1Q96JQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DCHS1Q96JQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DCHS1Q96JQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DCHS1Q96JQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DCHS1Q96JQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DCHS1Q96JQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DCHS1Q96JQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DCHS1Q96JQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DCHS1Q96JQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DCHS1Q96JQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DCHS1Q96JQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DCHS1Q96JQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DCHS1Q96JQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DCHS1Q96JQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DCHS1Q96JQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DCHS1Q96JQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DCHS1Q96JQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DCHS1Q96JQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DCHS1Q96JQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCHS1Q96JQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DCHS1Q96JQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DCHS1Q96JQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DCHS1Q96JQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DCHS1Q96JQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DCHS1Q96JQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DCHS1Q96JQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DCHS1Q96JQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DCHS1Q96JQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms