Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC56.52■■■■■ 6.64
JPH4Q96JJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.49■■■■■ 6.63
JPH4Q96JJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.84■■■■■ 6.53
JPH4Q96JJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.23■■■■■ 6.43
JPH4Q96JJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.54■■■■■ 6.32
JPH4Q96JJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.04■■■■■ 6.24
JPH4Q96JJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.03■■■■■ 6.24
JPH4Q96JJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.93■■■■■ 6.22
JPH4Q96JJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.78■■■■■ 6.2
JPH4Q96JJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
JPH4Q96JJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
JPH4Q96JJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.45■■■■■ 6.15
JPH4Q96JJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
JPH4Q96JJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.39■■■■■ 6.14
JPH4Q96JJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.37■■■■■ 6.13
JPH4Q96JJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
JPH4Q96JJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
JPH4Q96JJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.52■■■■■ 6
JPH4Q96JJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.45■■■■■ 5.99
JPH4Q96JJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
JPH4Q96JJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
JPH4Q96JJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
JPH4Q96JJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
JPH4Q96JJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC52.2■■■■■ 5.95
JPH4Q96JJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.12■■■■■ 5.93
JPH4Q96JJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
JPH4Q96JJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
JPH4Q96JJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC51.72■■■■■ 5.87
JPH4Q96JJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
JPH4Q96JJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC51.65■■■■■ 5.86
JPH4Q96JJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC51.43■■■■■ 5.82
JPH4Q96JJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
JPH4Q96JJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
JPH4Q96JJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
JPH4Q96JJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.1■■■■■ 5.77
JPH4Q96JJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
JPH4Q96JJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
JPH4Q96JJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.8■■■■■ 5.72
JPH4Q96JJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
JPH4Q96JJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
JPH4Q96JJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
JPH4Q96JJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.23■■■■■ 5.63
JPH4Q96JJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
JPH4Q96JJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.63
JPH4Q96JJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.05■■■■■ 5.6
JPH4Q96JJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
JPH4Q96JJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
JPH4Q96JJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
JPH4Q96JJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
JPH4Q96JJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
JPH4Q96JJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.79■■■■■ 5.56
JPH4Q96JJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
JPH4Q96JJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
JPH4Q96JJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC49.74■■■■■ 5.55
JPH4Q96JJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
JPH4Q96JJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
JPH4Q96JJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
JPH4Q96JJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
JPH4Q96JJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
JPH4Q96JJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
JPH4Q96JJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.49■■■■■ 5.51
JPH4Q96JJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.5
JPH4Q96JJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
JPH4Q96JJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
JPH4Q96JJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
JPH4Q96JJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
JPH4Q96JJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC49.19■■■■■ 5.47
JPH4Q96JJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
JPH4Q96JJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
JPH4Q96JJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
JPH4Q96JJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.08■■■■■ 5.45
JPH4Q96JJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
JPH4Q96JJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49■■■■■ 5.43
JPH4Q96JJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
JPH4Q96JJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
JPH4Q96JJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
JPH4Q96JJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
JPH4Q96JJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
JPH4Q96JJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
JPH4Q96JJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
JPH4Q96JJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
JPH4Q96JJ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
JPH4Q96JJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
JPH4Q96JJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
JPH4Q96JJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
JPH4Q96JJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
JPH4Q96JJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC48.62■■■■■ 5.37
JPH4Q96JJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.57■■■■■ 5.37
JPH4Q96JJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC48.47■■■■■ 5.35
JPH4Q96JJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
JPH4Q96JJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
JPH4Q96JJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
JPH4Q96JJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms