Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA7

SDSL, Serine dehydratase-like, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSLQ96GA7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDSLQ96GA7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSLQ96GA7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDSLQ96GA7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SDSLQ96GA7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SDSLQ96GA7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDSLQ96GA7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDSLQ96GA7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDSLQ96GA7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSLQ96GA7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSLQ96GA7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDSLQ96GA7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDSLQ96GA7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDSLQ96GA7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDSLQ96GA7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDSLQ96GA7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDSLQ96GA7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDSLQ96GA7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSLQ96GA7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSLQ96GA7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSLQ96GA7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSLQ96GA7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSLQ96GA7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDSLQ96GA7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDSLQ96GA7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDSLQ96GA7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDSLQ96GA7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDSLQ96GA7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDSLQ96GA7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDSLQ96GA7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SDSLQ96GA7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSLQ96GA7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSLQ96GA7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDSLQ96GA7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDSLQ96GA7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDSLQ96GA7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDSLQ96GA7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDSLQ96GA7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDSLQ96GA7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDSLQ96GA7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDSLQ96GA7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDSLQ96GA7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDSLQ96GA7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDSLQ96GA7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDSLQ96GA7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSLQ96GA7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSLQ96GA7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSLQ96GA7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSLQ96GA7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDSLQ96GA7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDSLQ96GA7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDSLQ96GA7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDSLQ96GA7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDSLQ96GA7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDSLQ96GA7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDSLQ96GA7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDSLQ96GA7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSLQ96GA7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDSLQ96GA7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SDSLQ96GA7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDSLQ96GA7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDSLQ96GA7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDSLQ96GA7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDSLQ96GA7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDSLQ96GA7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDSLQ96GA7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSLQ96GA7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDSLQ96GA7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDSLQ96GA7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDSLQ96GA7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDSLQ96GA7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDSLQ96GA7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDSLQ96GA7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSLQ96GA7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSLQ96GA7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSLQ96GA7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSLQ96GA7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDSLQ96GA7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDSLQ96GA7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSLQ96GA7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSLQ96GA7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSLQ96GA7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDSLQ96GA7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDSLQ96GA7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDSLQ96GA7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDSLQ96GA7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDSLQ96GA7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDSLQ96GA7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDSLQ96GA7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDSLQ96GA7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSLQ96GA7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDSLQ96GA7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDSLQ96GA7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms