Protein–RNA interactions for Protein: Q92988

DLX4, Homeobox protein DLX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX4Q92988 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DLX4Q92988 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DLX4Q92988 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLX4Q92988 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLX4Q92988 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DLX4Q92988 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLX4Q92988 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DLX4Q92988 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DLX4Q92988 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLX4Q92988 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLX4Q92988 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLX4Q92988 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLX4Q92988 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DLX4Q92988 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DLX4Q92988 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DLX4Q92988 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DLX4Q92988 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLX4Q92988 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DLX4Q92988 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLX4Q92988 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DLX4Q92988 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLX4Q92988 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLX4Q92988 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLX4Q92988 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DLX4Q92988 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLX4Q92988 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLX4Q92988 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLX4Q92988 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLX4Q92988 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLX4Q92988 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLX4Q92988 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLX4Q92988 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLX4Q92988 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLX4Q92988 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLX4Q92988 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLX4Q92988 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLX4Q92988 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DLX4Q92988 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLX4Q92988 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLX4Q92988 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLX4Q92988 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLX4Q92988 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLX4Q92988 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DLX4Q92988 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLX4Q92988 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLX4Q92988 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DLX4Q92988 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLX4Q92988 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLX4Q92988 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLX4Q92988 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLX4Q92988 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLX4Q92988 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLX4Q92988 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DLX4Q92988 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DLX4Q92988 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DLX4Q92988 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DLX4Q92988 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLX4Q92988 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DLX4Q92988 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLX4Q92988 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLX4Q92988 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLX4Q92988 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLX4Q92988 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLX4Q92988 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLX4Q92988 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLX4Q92988 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLX4Q92988 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLX4Q92988 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLX4Q92988 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLX4Q92988 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLX4Q92988 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DLX4Q92988 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DLX4Q92988 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLX4Q92988 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLX4Q92988 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLX4Q92988 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLX4Q92988 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLX4Q92988 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLX4Q92988 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DLX4Q92988 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLX4Q92988 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLX4Q92988 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX4Q92988 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLX4Q92988 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLX4Q92988 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLX4Q92988 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLX4Q92988 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms