Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.7■■■■■ 6.19
NEO1Q92859 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.47■■■■■ 6.15
NEO1Q92859 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53■■■■■ 6.07
NEO1Q92859 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
NEO1Q92859 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
NEO1Q92859 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.22■■■■■ 5.79
NEO1Q92859 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
NEO1Q92859 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.14■■■■■ 5.78
NEO1Q92859 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.12■■■■■ 5.77
NEO1Q92859 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
NEO1Q92859 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
NEO1Q92859 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.75■■■■■ 5.71
NEO1Q92859 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
NEO1Q92859 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
NEO1Q92859 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
NEO1Q92859 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
NEO1Q92859 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
NEO1Q92859 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
NEO1Q92859 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NEO1Q92859 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NEO1Q92859 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
NEO1Q92859 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
NEO1Q92859 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
NEO1Q92859 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.48■■■■■ 5.51
NEO1Q92859 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
NEO1Q92859 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
NEO1Q92859 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
NEO1Q92859 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
NEO1Q92859 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.06■■■■■ 5.44
NEO1Q92859 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
NEO1Q92859 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.9■■■■■ 5.42
NEO1Q92859 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
NEO1Q92859 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
NEO1Q92859 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
NEO1Q92859 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NEO1Q92859 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
NEO1Q92859 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
NEO1Q92859 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
NEO1Q92859 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
NEO1Q92859 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
NEO1Q92859 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
NEO1Q92859 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.58■■■■■ 5.21
NEO1Q92859 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
NEO1Q92859 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
NEO1Q92859 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
NEO1Q92859 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
NEO1Q92859 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NEO1Q92859 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NEO1Q92859 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NEO1Q92859 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NEO1Q92859 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NEO1Q92859 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NEO1Q92859 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
NEO1Q92859 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
NEO1Q92859 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NEO1Q92859 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
NEO1Q92859 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
NEO1Q92859 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
NEO1Q92859 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
NEO1Q92859 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
NEO1Q92859 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
NEO1Q92859 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
NEO1Q92859 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
NEO1Q92859 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
NEO1Q92859 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
NEO1Q92859 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NEO1Q92859 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
NEO1Q92859 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
NEO1Q92859 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NEO1Q92859 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NEO1Q92859 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
NEO1Q92859 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
NEO1Q92859 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
NEO1Q92859 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
NEO1Q92859 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NEO1Q92859 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
NEO1Q92859 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
NEO1Q92859 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NEO1Q92859 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NEO1Q92859 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
NEO1Q92859 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
NEO1Q92859 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
NEO1Q92859 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
NEO1Q92859 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
NEO1Q92859 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
NEO1Q92859 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
NEO1Q92859 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NEO1Q92859 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
NEO1Q92859 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
NEO1Q92859 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NEO1Q92859 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NEO1Q92859 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
NEO1Q92859 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NEO1Q92859 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms