Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.96■■■■■ 5.75
TNRQ92752 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.93■■■■■ 5.74
TNRQ92752 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.3■■■■■ 5.64
TNRQ92752 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
TNRQ92752 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
TNRQ92752 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.75■■■■■ 5.4
TNRQ92752 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.7■■■■■ 5.39
TNRQ92752 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
TNRQ92752 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.56■■■■■ 5.36
TNRQ92752 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
TNRQ92752 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
TNRQ92752 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
TNRQ92752 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
TNRQ92752 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
TNRQ92752 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
TNRQ92752 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
TNRQ92752 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
TNRQ92752 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
TNRQ92752 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
TNRQ92752 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
TNRQ92752 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
TNRQ92752 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
TNRQ92752 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
TNRQ92752 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
TNRQ92752 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
TNRQ92752 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
TNRQ92752 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
TNRQ92752 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
TNRQ92752 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
TNRQ92752 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
TNRQ92752 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.02
TNRQ92752 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
TNRQ92752 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
TNRQ92752 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
TNRQ92752 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TNRQ92752 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
TNRQ92752 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
TNRQ92752 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
TNRQ92752 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
TNRQ92752 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
TNRQ92752 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
TNRQ92752 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
TNRQ92752 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
TNRQ92752 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
TNRQ92752 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
TNRQ92752 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
TNRQ92752 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
TNRQ92752 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
TNRQ92752 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TNRQ92752 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TNRQ92752 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
TNRQ92752 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
TNRQ92752 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TNRQ92752 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
TNRQ92752 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
TNRQ92752 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TNRQ92752 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
TNRQ92752 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
TNRQ92752 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TNRQ92752 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TNRQ92752 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
TNRQ92752 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TNRQ92752 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNRQ92752 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
TNRQ92752 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TNRQ92752 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TNRQ92752 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TNRQ92752 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TNRQ92752 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TNRQ92752 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
TNRQ92752 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TNRQ92752 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
TNRQ92752 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TNRQ92752 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TNRQ92752 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
TNRQ92752 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TNRQ92752 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
TNRQ92752 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TNRQ92752 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TNRQ92752 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TNRQ92752 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TNRQ92752 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
TNRQ92752 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TNRQ92752 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.63
TNRQ92752 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TNRQ92752 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
TNRQ92752 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TNRQ92752 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TNRQ92752 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
TNRQ92752 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TNRQ92752 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TNRQ92752 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TNRQ92752 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TNRQ92752 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TNRQ92752 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TNRQ92752 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNRQ92752 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNRQ92752 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TNRQ92752 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TNRQ92752 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms