Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.42■■■■■ 6.94
ABCA10Q8WWZ4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.18■■■■■ 6.9
ABCA10Q8WWZ4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.37■■■■■ 6.77
ABCA10Q8WWZ4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.1■■■■■ 6.73
ABCA10Q8WWZ4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.49■■■■■ 6.63
ABCA10Q8WWZ4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.05■■■■■ 6.56
ABCA10Q8WWZ4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.72■■■■■ 6.51
ABCA10Q8WWZ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.55■■■■■ 6.48
ABCA10Q8WWZ4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC55.54■■■■■ 6.48
ABCA10Q8WWZ4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.39■■■■■ 6.46
ABCA10Q8WWZ4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.24■■■■■ 6.43
ABCA10Q8WWZ4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.2■■■■■ 6.43
ABCA10Q8WWZ4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.17■■■■■ 6.42
ABCA10Q8WWZ4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.01■■■■■ 6.4
ABCA10Q8WWZ4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.7■■■■■ 6.35
ABCA10Q8WWZ4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
ABCA10Q8WWZ4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.46■■■■■ 6.31
ABCA10Q8WWZ4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
ABCA10Q8WWZ4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
ABCA10Q8WWZ4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
ABCA10Q8WWZ4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.78■■■■■ 6.2
ABCA10Q8WWZ4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.73■■■■■ 6.19
ABCA10Q8WWZ4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
ABCA10Q8WWZ4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
ABCA10Q8WWZ4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.59■■■■■ 6.17
ABCA10Q8WWZ4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.54■■■■■ 6.16
ABCA10Q8WWZ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
ABCA10Q8WWZ4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.34■■■■■ 6.13
ABCA10Q8WWZ4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.32■■■■■ 6.13
ABCA10Q8WWZ4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
ABCA10Q8WWZ4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.06■■■■■ 6.08
ABCA10Q8WWZ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53■■■■■ 6.07
ABCA10Q8WWZ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.99■■■■■ 6.07
ABCA10Q8WWZ4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
ABCA10Q8WWZ4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCA10Q8WWZ4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.54■■■■■ 6
ABCA10Q8WWZ4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 6
ABCA10Q8WWZ4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
ABCA10Q8WWZ4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
ABCA10Q8WWZ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
ABCA10Q8WWZ4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.99■■■■■ 5.91
ABCA10Q8WWZ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.75■■■■■ 5.88
ABCA10Q8WWZ4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
ABCA10Q8WWZ4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
ABCA10Q8WWZ4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
ABCA10Q8WWZ4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
ABCA10Q8WWZ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.41■■■■■ 5.82
ABCA10Q8WWZ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
ABCA10Q8WWZ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.37■■■■■ 5.81
ABCA10Q8WWZ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCA10Q8WWZ4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
ABCA10Q8WWZ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
ABCA10Q8WWZ4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
ABCA10Q8WWZ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
ABCA10Q8WWZ4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.77
ABCA10Q8WWZ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCA10Q8WWZ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCA10Q8WWZ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
ABCA10Q8WWZ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
ABCA10Q8WWZ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.99■■■■■ 5.75
ABCA10Q8WWZ4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
ABCA10Q8WWZ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCA10Q8WWZ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCA10Q8WWZ4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.7
ABCA10Q8WWZ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
ABCA10Q8WWZ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.67■■■■■ 5.7
ABCA10Q8WWZ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ABCA10Q8WWZ4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
ABCA10Q8WWZ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
ABCA10Q8WWZ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
ABCA10Q8WWZ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
ABCA10Q8WWZ4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.53■■■■■ 5.68
ABCA10Q8WWZ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
ABCA10Q8WWZ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
ABCA10Q8WWZ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCA10Q8WWZ4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.65
ABCA10Q8WWZ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.27■■■■■ 5.64
ABCA10Q8WWZ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ABCA10Q8WWZ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
ABCA10Q8WWZ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ABCA10Q8WWZ4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
ABCA10Q8WWZ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.17■■■■■ 5.62
ABCA10Q8WWZ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
ABCA10Q8WWZ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.01■■■■■ 5.6
ABCA10Q8WWZ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCA10Q8WWZ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCA10Q8WWZ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCA10Q8WWZ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCA10Q8WWZ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
ABCA10Q8WWZ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCA10Q8WWZ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.81■■■■■ 5.56
ABCA10Q8WWZ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
ABCA10Q8WWZ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCA10Q8WWZ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
ABCA10Q8WWZ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms