Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RASGRP4Q8TDF6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RASGRP4Q8TDF6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
RASGRP4Q8TDF6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RASGRP4Q8TDF6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RASGRP4Q8TDF6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RASGRP4Q8TDF6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RASGRP4Q8TDF6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RASGRP4Q8TDF6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RASGRP4Q8TDF6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RASGRP4Q8TDF6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RASGRP4Q8TDF6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RASGRP4Q8TDF6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RASGRP4Q8TDF6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RASGRP4Q8TDF6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RASGRP4Q8TDF6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RASGRP4Q8TDF6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RASGRP4Q8TDF6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RASGRP4Q8TDF6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RASGRP4Q8TDF6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RASGRP4Q8TDF6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RASGRP4Q8TDF6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RASGRP4Q8TDF6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RASGRP4Q8TDF6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RASGRP4Q8TDF6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RASGRP4Q8TDF6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RASGRP4Q8TDF6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RASGRP4Q8TDF6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RASGRP4Q8TDF6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RASGRP4Q8TDF6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RASGRP4Q8TDF6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RASGRP4Q8TDF6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RASGRP4Q8TDF6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RASGRP4Q8TDF6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RASGRP4Q8TDF6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RASGRP4Q8TDF6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RASGRP4Q8TDF6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RASGRP4Q8TDF6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RASGRP4Q8TDF6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RASGRP4Q8TDF6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RASGRP4Q8TDF6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RASGRP4Q8TDF6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RASGRP4Q8TDF6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RASGRP4Q8TDF6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RASGRP4Q8TDF6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RASGRP4Q8TDF6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RASGRP4Q8TDF6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RASGRP4Q8TDF6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RASGRP4Q8TDF6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RASGRP4Q8TDF6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RASGRP4Q8TDF6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RASGRP4Q8TDF6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RASGRP4Q8TDF6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RASGRP4Q8TDF6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RASGRP4Q8TDF6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RASGRP4Q8TDF6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RASGRP4Q8TDF6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RASGRP4Q8TDF6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RASGRP4Q8TDF6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RASGRP4Q8TDF6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RASGRP4Q8TDF6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RASGRP4Q8TDF6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RASGRP4Q8TDF6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RASGRP4Q8TDF6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RASGRP4Q8TDF6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RASGRP4Q8TDF6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RASGRP4Q8TDF6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RASGRP4Q8TDF6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RASGRP4Q8TDF6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RASGRP4Q8TDF6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RASGRP4Q8TDF6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RASGRP4Q8TDF6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RASGRP4Q8TDF6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RASGRP4Q8TDF6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RASGRP4Q8TDF6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RASGRP4Q8TDF6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RASGRP4Q8TDF6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RASGRP4Q8TDF6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RASGRP4Q8TDF6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RASGRP4Q8TDF6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RASGRP4Q8TDF6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RASGRP4Q8TDF6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RASGRP4Q8TDF6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RASGRP4Q8TDF6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RASGRP4Q8TDF6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RASGRP4Q8TDF6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RASGRP4Q8TDF6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RASGRP4Q8TDF6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RASGRP4Q8TDF6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RASGRP4Q8TDF6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RASGRP4Q8TDF6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RASGRP4Q8TDF6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RASGRP4Q8TDF6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RASGRP4Q8TDF6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RASGRP4Q8TDF6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RASGRP4Q8TDF6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RASGRP4Q8TDF6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RASGRP4Q8TDF6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms