Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SPATA18Q8TC71 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SPATA18Q8TC71 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPATA18Q8TC71 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPATA18Q8TC71 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPATA18Q8TC71 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPATA18Q8TC71 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SPATA18Q8TC71 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SPATA18Q8TC71 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SPATA18Q8TC71 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SPATA18Q8TC71 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SPATA18Q8TC71 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPATA18Q8TC71 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SPATA18Q8TC71 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPATA18Q8TC71 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPATA18Q8TC71 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPATA18Q8TC71 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPATA18Q8TC71 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SPATA18Q8TC71 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPATA18Q8TC71 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPATA18Q8TC71 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPATA18Q8TC71 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPATA18Q8TC71 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPATA18Q8TC71 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPATA18Q8TC71 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SPATA18Q8TC71 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPATA18Q8TC71 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SPATA18Q8TC71 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SPATA18Q8TC71 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPATA18Q8TC71 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPATA18Q8TC71 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SPATA18Q8TC71 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPATA18Q8TC71 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPATA18Q8TC71 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPATA18Q8TC71 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPATA18Q8TC71 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPATA18Q8TC71 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SPATA18Q8TC71 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPATA18Q8TC71 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPATA18Q8TC71 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SPATA18Q8TC71 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SPATA18Q8TC71 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SPATA18Q8TC71 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPATA18Q8TC71 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPATA18Q8TC71 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SPATA18Q8TC71 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPATA18Q8TC71 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPATA18Q8TC71 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPATA18Q8TC71 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPATA18Q8TC71 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPATA18Q8TC71 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPATA18Q8TC71 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPATA18Q8TC71 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPATA18Q8TC71 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SPATA18Q8TC71 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPATA18Q8TC71 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPATA18Q8TC71 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPATA18Q8TC71 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SPATA18Q8TC71 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPATA18Q8TC71 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPATA18Q8TC71 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPATA18Q8TC71 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPATA18Q8TC71 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPATA18Q8TC71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SPATA18Q8TC71 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPATA18Q8TC71 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPATA18Q8TC71 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPATA18Q8TC71 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPATA18Q8TC71 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPATA18Q8TC71 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPATA18Q8TC71 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPATA18Q8TC71 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPATA18Q8TC71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPATA18Q8TC71 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPATA18Q8TC71 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SPATA18Q8TC71 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SPATA18Q8TC71 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SPATA18Q8TC71 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SPATA18Q8TC71 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPATA18Q8TC71 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SPATA18Q8TC71 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SPATA18Q8TC71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SPATA18Q8TC71 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SPATA18Q8TC71 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPATA18Q8TC71 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SPATA18Q8TC71 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPATA18Q8TC71 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SPATA18Q8TC71 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPATA18Q8TC71 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SPATA18Q8TC71 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SPATA18Q8TC71 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SPATA18Q8TC71 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SPATA18Q8TC71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SPATA18Q8TC71 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SPATA18Q8TC71 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
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