Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.19■■■■■ 5.3
USP32Q8NFA0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.64■■■■■ 5.22
USP32Q8NFA0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
USP32Q8NFA0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
USP32Q8NFA0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
USP32Q8NFA0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
USP32Q8NFA0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
USP32Q8NFA0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
USP32Q8NFA0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
USP32Q8NFA0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.47■■■■■ 4.87
USP32Q8NFA0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.86
USP32Q8NFA0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
USP32Q8NFA0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
USP32Q8NFA0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
USP32Q8NFA0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
USP32Q8NFA0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
USP32Q8NFA0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
USP32Q8NFA0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
USP32Q8NFA0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
USP32Q8NFA0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
USP32Q8NFA0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
USP32Q8NFA0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
USP32Q8NFA0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
USP32Q8NFA0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
USP32Q8NFA0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
USP32Q8NFA0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
USP32Q8NFA0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
USP32Q8NFA0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
USP32Q8NFA0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
USP32Q8NFA0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
USP32Q8NFA0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
USP32Q8NFA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
USP32Q8NFA0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
USP32Q8NFA0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
USP32Q8NFA0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
USP32Q8NFA0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
USP32Q8NFA0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
USP32Q8NFA0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
USP32Q8NFA0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
USP32Q8NFA0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
USP32Q8NFA0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
USP32Q8NFA0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
USP32Q8NFA0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
USP32Q8NFA0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
USP32Q8NFA0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
USP32Q8NFA0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
USP32Q8NFA0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
USP32Q8NFA0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
USP32Q8NFA0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
USP32Q8NFA0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
USP32Q8NFA0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
USP32Q8NFA0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
USP32Q8NFA0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
USP32Q8NFA0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
USP32Q8NFA0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
USP32Q8NFA0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
USP32Q8NFA0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
USP32Q8NFA0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
USP32Q8NFA0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
USP32Q8NFA0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
USP32Q8NFA0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
USP32Q8NFA0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
USP32Q8NFA0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
USP32Q8NFA0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
USP32Q8NFA0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
USP32Q8NFA0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
USP32Q8NFA0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
USP32Q8NFA0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
USP32Q8NFA0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
USP32Q8NFA0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
USP32Q8NFA0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
USP32Q8NFA0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
USP32Q8NFA0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
USP32Q8NFA0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
USP32Q8NFA0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
USP32Q8NFA0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
USP32Q8NFA0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
USP32Q8NFA0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
USP32Q8NFA0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
USP32Q8NFA0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
USP32Q8NFA0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
USP32Q8NFA0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
USP32Q8NFA0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
USP32Q8NFA0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
USP32Q8NFA0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
USP32Q8NFA0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
USP32Q8NFA0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
USP32Q8NFA0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
USP32Q8NFA0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
USP32Q8NFA0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
USP32Q8NFA0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
USP32Q8NFA0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
USP32Q8NFA0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
USP32Q8NFA0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
USP32Q8NFA0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms