Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDM7

CFAP43, Cilia- and flagella-associated protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP43Q8NDM7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.24■■■■■ 6.27
CFAP43Q8NDM7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.93■■■■■ 6.22
CFAP43Q8NDM7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.63■■■■■ 6.18
CFAP43Q8NDM7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
CFAP43Q8NDM7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
CFAP43Q8NDM7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
CFAP43Q8NDM7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.24■■■■■ 5.95
CFAP43Q8NDM7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.07■■■■■ 5.93
CFAP43Q8NDM7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CFAP43Q8NDM7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.77■■■■■ 5.88
CFAP43Q8NDM7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.76■■■■■ 5.88
CFAP43Q8NDM7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.58■■■■■ 5.85
CFAP43Q8NDM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
CFAP43Q8NDM7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.37■■■■■ 5.81
CFAP43Q8NDM7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.19■■■■■ 5.79
CFAP43Q8NDM7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
CFAP43Q8NDM7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CFAP43Q8NDM7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
CFAP43Q8NDM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
CFAP43Q8NDM7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
CFAP43Q8NDM7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CFAP43Q8NDM7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
CFAP43Q8NDM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CFAP43Q8NDM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CFAP43Q8NDM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CFAP43Q8NDM7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
CFAP43Q8NDM7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CFAP43Q8NDM7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50■■■■■ 5.59
CFAP43Q8NDM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
CFAP43Q8NDM7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
CFAP43Q8NDM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
CFAP43Q8NDM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
CFAP43Q8NDM7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CFAP43Q8NDM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CFAP43Q8NDM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CFAP43Q8NDM7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
CFAP43Q8NDM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
CFAP43Q8NDM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
CFAP43Q8NDM7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
CFAP43Q8NDM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
CFAP43Q8NDM7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
CFAP43Q8NDM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
CFAP43Q8NDM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.59■■■■■ 5.37
CFAP43Q8NDM7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
CFAP43Q8NDM7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CFAP43Q8NDM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
CFAP43Q8NDM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CFAP43Q8NDM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CFAP43Q8NDM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CFAP43Q8NDM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
CFAP43Q8NDM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
CFAP43Q8NDM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
CFAP43Q8NDM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
CFAP43Q8NDM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
CFAP43Q8NDM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CFAP43Q8NDM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CFAP43Q8NDM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
CFAP43Q8NDM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
CFAP43Q8NDM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.73■■■■■ 5.23
CFAP43Q8NDM7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
CFAP43Q8NDM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
CFAP43Q8NDM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
CFAP43Q8NDM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
CFAP43Q8NDM7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
CFAP43Q8NDM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CFAP43Q8NDM7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CFAP43Q8NDM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
CFAP43Q8NDM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
CFAP43Q8NDM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
CFAP43Q8NDM7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
CFAP43Q8NDM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CFAP43Q8NDM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.28■■■■■ 5.16
CFAP43Q8NDM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CFAP43Q8NDM7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
CFAP43Q8NDM7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
CFAP43Q8NDM7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CFAP43Q8NDM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CFAP43Q8NDM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
CFAP43Q8NDM7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CFAP43Q8NDM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CFAP43Q8NDM7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CFAP43Q8NDM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CFAP43Q8NDM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CFAP43Q8NDM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CFAP43Q8NDM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
CFAP43Q8NDM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CFAP43Q8NDM7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CFAP43Q8NDM7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CFAP43Q8NDM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CFAP43Q8NDM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CFAP43Q8NDM7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CFAP43Q8NDM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CFAP43Q8NDM7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CFAP43Q8NDM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms