Protein–RNA interactions for Protein: Q8N556

AFAP1, Actin filament-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1Q8N556 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.95■■■■■ 6.07
AFAP1Q8N556 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.64■■■■■ 6.02
AFAP1Q8N556 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.97■■■■■ 5.91
AFAP1Q8N556 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
AFAP1Q8N556 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
AFAP1Q8N556 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.77■■■■■ 5.72
AFAP1Q8N556 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
AFAP1Q8N556 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
AFAP1Q8N556 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.31■■■■■ 5.64
AFAP1Q8N556 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.13■■■■■ 5.62
AFAP1Q8N556 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
AFAP1Q8N556 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
AFAP1Q8N556 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
AFAP1Q8N556 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
AFAP1Q8N556 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
AFAP1Q8N556 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
AFAP1Q8N556 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
AFAP1Q8N556 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
AFAP1Q8N556 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
AFAP1Q8N556 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
AFAP1Q8N556 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
AFAP1Q8N556 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
AFAP1Q8N556 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
AFAP1Q8N556 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
AFAP1Q8N556 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
AFAP1Q8N556 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
AFAP1Q8N556 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
AFAP1Q8N556 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
AFAP1Q8N556 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
AFAP1Q8N556 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
AFAP1Q8N556 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
AFAP1Q8N556 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
AFAP1Q8N556 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
AFAP1Q8N556 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.91■■■■■ 5.26
AFAP1Q8N556 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
AFAP1Q8N556 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
AFAP1Q8N556 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
AFAP1Q8N556 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
AFAP1Q8N556 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
AFAP1Q8N556 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
AFAP1Q8N556 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
AFAP1Q8N556 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
AFAP1Q8N556 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
AFAP1Q8N556 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
AFAP1Q8N556 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
AFAP1Q8N556 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
AFAP1Q8N556 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
AFAP1Q8N556 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
AFAP1Q8N556 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
AFAP1Q8N556 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
AFAP1Q8N556 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
AFAP1Q8N556 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
AFAP1Q8N556 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
AFAP1Q8N556 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
AFAP1Q8N556 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.43■■■■■ 5.02
AFAP1Q8N556 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
AFAP1Q8N556 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
AFAP1Q8N556 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
AFAP1Q8N556 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
AFAP1Q8N556 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
AFAP1Q8N556 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
AFAP1Q8N556 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
AFAP1Q8N556 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
AFAP1Q8N556 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
AFAP1Q8N556 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
AFAP1Q8N556 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
AFAP1Q8N556 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
AFAP1Q8N556 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
AFAP1Q8N556 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
AFAP1Q8N556 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
AFAP1Q8N556 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
AFAP1Q8N556 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
AFAP1Q8N556 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
AFAP1Q8N556 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
AFAP1Q8N556 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
AFAP1Q8N556 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
AFAP1Q8N556 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
AFAP1Q8N556 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.68■■■■■ 4.9
AFAP1Q8N556 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
AFAP1Q8N556 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
AFAP1Q8N556 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
AFAP1Q8N556 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
AFAP1Q8N556 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
AFAP1Q8N556 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
AFAP1Q8N556 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
AFAP1Q8N556 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
AFAP1Q8N556 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.43■■■■■ 4.86
AFAP1Q8N556 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
AFAP1Q8N556 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
AFAP1Q8N556 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
AFAP1Q8N556 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
AFAP1Q8N556 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
AFAP1Q8N556 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
AFAP1Q8N556 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
AFAP1Q8N556 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
AFAP1Q8N556 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
AFAP1Q8N556 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
AFAP1Q8N556 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
AFAP1Q8N556 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
AFAP1Q8N556 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms