Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
PROM2Q8N271 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
PROM2Q8N271 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
PROM2Q8N271 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PROM2Q8N271 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PROM2Q8N271 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PROM2Q8N271 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PROM2Q8N271 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PROM2Q8N271 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PROM2Q8N271 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PROM2Q8N271 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PROM2Q8N271 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PROM2Q8N271 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PROM2Q8N271 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PROM2Q8N271 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
PROM2Q8N271 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PROM2Q8N271 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
PROM2Q8N271 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PROM2Q8N271 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PROM2Q8N271 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PROM2Q8N271 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PROM2Q8N271 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PROM2Q8N271 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PROM2Q8N271 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PROM2Q8N271 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PROM2Q8N271 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PROM2Q8N271 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PROM2Q8N271 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
PROM2Q8N271 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
PROM2Q8N271 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PROM2Q8N271 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
PROM2Q8N271 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PROM2Q8N271 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
PROM2Q8N271 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PROM2Q8N271 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PROM2Q8N271 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PROM2Q8N271 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PROM2Q8N271 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PROM2Q8N271 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PROM2Q8N271 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PROM2Q8N271 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PROM2Q8N271 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PROM2Q8N271 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PROM2Q8N271 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PROM2Q8N271 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PROM2Q8N271 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PROM2Q8N271 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PROM2Q8N271 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PROM2Q8N271 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PROM2Q8N271 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PROM2Q8N271 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PROM2Q8N271 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PROM2Q8N271 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PROM2Q8N271 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PROM2Q8N271 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PROM2Q8N271 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PROM2Q8N271 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PROM2Q8N271 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PROM2Q8N271 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PROM2Q8N271 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PROM2Q8N271 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PROM2Q8N271 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PROM2Q8N271 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PROM2Q8N271 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PROM2Q8N271 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PROM2Q8N271 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PROM2Q8N271 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PROM2Q8N271 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
PROM2Q8N271 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PROM2Q8N271 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PROM2Q8N271 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PROM2Q8N271 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PROM2Q8N271 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
PROM2Q8N271 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PROM2Q8N271 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PROM2Q8N271 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PROM2Q8N271 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PROM2Q8N271 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PROM2Q8N271 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PROM2Q8N271 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PROM2Q8N271 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PROM2Q8N271 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PROM2Q8N271 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39■■■■□ 3.83
PROM2Q8N271 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PROM2Q8N271 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PROM2Q8N271 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PROM2Q8N271 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PROM2Q8N271 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PROM2Q8N271 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms