Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
KLHL34Q8N239 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KLHL34Q8N239 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
KLHL34Q8N239 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
KLHL34Q8N239 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KLHL34Q8N239 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
KLHL34Q8N239 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
KLHL34Q8N239 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
KLHL34Q8N239 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
KLHL34Q8N239 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KLHL34Q8N239 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KLHL34Q8N239 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
KLHL34Q8N239 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
KLHL34Q8N239 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
KLHL34Q8N239 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
KLHL34Q8N239 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KLHL34Q8N239 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
KLHL34Q8N239 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
KLHL34Q8N239 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
KLHL34Q8N239 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
KLHL34Q8N239 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
KLHL34Q8N239 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
KLHL34Q8N239 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
KLHL34Q8N239 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KLHL34Q8N239 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KLHL34Q8N239 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
KLHL34Q8N239 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KLHL34Q8N239 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
KLHL34Q8N239 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
KLHL34Q8N239 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
KLHL34Q8N239 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KLHL34Q8N239 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
KLHL34Q8N239 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
KLHL34Q8N239 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KLHL34Q8N239 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
KLHL34Q8N239 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KLHL34Q8N239 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KLHL34Q8N239 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
KLHL34Q8N239 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KLHL34Q8N239 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
KLHL34Q8N239 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KLHL34Q8N239 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
KLHL34Q8N239 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
KLHL34Q8N239 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KLHL34Q8N239 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KLHL34Q8N239 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KLHL34Q8N239 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KLHL34Q8N239 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KLHL34Q8N239 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KLHL34Q8N239 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KLHL34Q8N239 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KLHL34Q8N239 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KLHL34Q8N239 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KLHL34Q8N239 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
KLHL34Q8N239 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
KLHL34Q8N239 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
KLHL34Q8N239 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
KLHL34Q8N239 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KLHL34Q8N239 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KLHL34Q8N239 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KLHL34Q8N239 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
KLHL34Q8N239 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KLHL34Q8N239 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KLHL34Q8N239 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KLHL34Q8N239 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KLHL34Q8N239 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
KLHL34Q8N239 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KLHL34Q8N239 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KLHL34Q8N239 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
KLHL34Q8N239 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
KLHL34Q8N239 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
KLHL34Q8N239 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
KLHL34Q8N239 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KLHL34Q8N239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KLHL34Q8N239 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KLHL34Q8N239 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
KLHL34Q8N239 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KLHL34Q8N239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KLHL34Q8N239 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KLHL34Q8N239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KLHL34Q8N239 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KLHL34Q8N239 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
KLHL34Q8N239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KLHL34Q8N239 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
KLHL34Q8N239 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KLHL34Q8N239 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KLHL34Q8N239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KLHL34Q8N239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KLHL34Q8N239 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KLHL34Q8N239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KLHL34Q8N239 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
KLHL34Q8N239 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KLHL34Q8N239 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KLHL34Q8N239 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms