Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KLHL34Q8N239 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
KLHL34Q8N239 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KLHL34Q8N239 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
KLHL34Q8N239 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
KLHL34Q8N239 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KLHL34Q8N239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KLHL34Q8N239 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KLHL34Q8N239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KLHL34Q8N239 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KLHL34Q8N239 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KLHL34Q8N239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KLHL34Q8N239 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KLHL34Q8N239 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KLHL34Q8N239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KLHL34Q8N239 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
KLHL34Q8N239 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KLHL34Q8N239 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
KLHL34Q8N239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
KLHL34Q8N239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
KLHL34Q8N239 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KLHL34Q8N239 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KLHL34Q8N239 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KLHL34Q8N239 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KLHL34Q8N239 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KLHL34Q8N239 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KLHL34Q8N239 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KLHL34Q8N239 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KLHL34Q8N239 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KLHL34Q8N239 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KLHL34Q8N239 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
KLHL34Q8N239 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KLHL34Q8N239 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KLHL34Q8N239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KLHL34Q8N239 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KLHL34Q8N239 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
KLHL34Q8N239 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KLHL34Q8N239 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KLHL34Q8N239 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KLHL34Q8N239 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KLHL34Q8N239 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
KLHL34Q8N239 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KLHL34Q8N239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KLHL34Q8N239 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
KLHL34Q8N239 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KLHL34Q8N239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
KLHL34Q8N239 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KLHL34Q8N239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KLHL34Q8N239 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KLHL34Q8N239 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
KLHL34Q8N239 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KLHL34Q8N239 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KLHL34Q8N239 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KLHL34Q8N239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KLHL34Q8N239 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KLHL34Q8N239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KLHL34Q8N239 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KLHL34Q8N239 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KLHL34Q8N239 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KLHL34Q8N239 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KLHL34Q8N239 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KLHL34Q8N239 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KLHL34Q8N239 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KLHL34Q8N239 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KLHL34Q8N239 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KLHL34Q8N239 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KLHL34Q8N239 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms