Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.72■■■■■ 4.75
VSIG10Q8N0Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
VSIG10Q8N0Z9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
VSIG10Q8N0Z9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
VSIG10Q8N0Z9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
VSIG10Q8N0Z9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
VSIG10Q8N0Z9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
VSIG10Q8N0Z9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
VSIG10Q8N0Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
VSIG10Q8N0Z9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
VSIG10Q8N0Z9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
VSIG10Q8N0Z9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
VSIG10Q8N0Z9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
VSIG10Q8N0Z9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
VSIG10Q8N0Z9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.23
VSIG10Q8N0Z9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
VSIG10Q8N0Z9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
VSIG10Q8N0Z9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
VSIG10Q8N0Z9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
VSIG10Q8N0Z9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
VSIG10Q8N0Z9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
VSIG10Q8N0Z9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
VSIG10Q8N0Z9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
VSIG10Q8N0Z9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
VSIG10Q8N0Z9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
VSIG10Q8N0Z9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
VSIG10Q8N0Z9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
VSIG10Q8N0Z9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
VSIG10Q8N0Z9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
VSIG10Q8N0Z9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
VSIG10Q8N0Z9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
VSIG10Q8N0Z9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40■■■■□ 3.99
VSIG10Q8N0Z9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
VSIG10Q8N0Z9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
VSIG10Q8N0Z9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
VSIG10Q8N0Z9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
VSIG10Q8N0Z9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
VSIG10Q8N0Z9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
VSIG10Q8N0Z9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
VSIG10Q8N0Z9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
VSIG10Q8N0Z9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
VSIG10Q8N0Z9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
VSIG10Q8N0Z9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
VSIG10Q8N0Z9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
VSIG10Q8N0Z9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
VSIG10Q8N0Z9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
VSIG10Q8N0Z9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
VSIG10Q8N0Z9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
VSIG10Q8N0Z9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
VSIG10Q8N0Z9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
VSIG10Q8N0Z9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
VSIG10Q8N0Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
VSIG10Q8N0Z9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
VSIG10Q8N0Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
VSIG10Q8N0Z9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
VSIG10Q8N0Z9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
VSIG10Q8N0Z9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
VSIG10Q8N0Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
VSIG10Q8N0Z9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
VSIG10Q8N0Z9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
VSIG10Q8N0Z9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
VSIG10Q8N0Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
VSIG10Q8N0Z9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
VSIG10Q8N0Z9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
VSIG10Q8N0Z9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VSIG10Q8N0Z9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
VSIG10Q8N0Z9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
VSIG10Q8N0Z9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
VSIG10Q8N0Z9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VSIG10Q8N0Z9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
VSIG10Q8N0Z9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
VSIG10Q8N0Z9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
VSIG10Q8N0Z9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VSIG10Q8N0Z9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
VSIG10Q8N0Z9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
VSIG10Q8N0Z9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
VSIG10Q8N0Z9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
VSIG10Q8N0Z9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VSIG10Q8N0Z9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
VSIG10Q8N0Z9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
VSIG10Q8N0Z9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VSIG10Q8N0Z9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
VSIG10Q8N0Z9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms