Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWU2

LMTK2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK2Q8IWU2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.23■■■■■ 5.79
LMTK2Q8IWU2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.7■■■■■ 5.71
LMTK2Q8IWU2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.6
LMTK2Q8IWU2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.91■■■■■ 5.58
LMTK2Q8IWU2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
LMTK2Q8IWU2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
LMTK2Q8IWU2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
LMTK2Q8IWU2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.94■■■■■ 5.42
LMTK2Q8IWU2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
LMTK2Q8IWU2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.25■■■■■ 5.31
LMTK2Q8IWU2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
LMTK2Q8IWU2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.2■■■■■ 5.31
LMTK2Q8IWU2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
LMTK2Q8IWU2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
LMTK2Q8IWU2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
LMTK2Q8IWU2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
LMTK2Q8IWU2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
LMTK2Q8IWU2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
LMTK2Q8IWU2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
LMTK2Q8IWU2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
LMTK2Q8IWU2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.12
LMTK2Q8IWU2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
LMTK2Q8IWU2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
LMTK2Q8IWU2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
LMTK2Q8IWU2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
LMTK2Q8IWU2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
LMTK2Q8IWU2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.06
LMTK2Q8IWU2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
LMTK2Q8IWU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
LMTK2Q8IWU2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
LMTK2Q8IWU2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
LMTK2Q8IWU2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
LMTK2Q8IWU2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
LMTK2Q8IWU2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
LMTK2Q8IWU2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
LMTK2Q8IWU2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46■■■■■ 4.95
LMTK2Q8IWU2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
LMTK2Q8IWU2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
LMTK2Q8IWU2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
LMTK2Q8IWU2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
LMTK2Q8IWU2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
LMTK2Q8IWU2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
LMTK2Q8IWU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
LMTK2Q8IWU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
LMTK2Q8IWU2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
LMTK2Q8IWU2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
LMTK2Q8IWU2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
LMTK2Q8IWU2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
LMTK2Q8IWU2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
LMTK2Q8IWU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
LMTK2Q8IWU2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
LMTK2Q8IWU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.67■■■■■ 4.74
LMTK2Q8IWU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
LMTK2Q8IWU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
LMTK2Q8IWU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
LMTK2Q8IWU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
LMTK2Q8IWU2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LMTK2Q8IWU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LMTK2Q8IWU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
LMTK2Q8IWU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
LMTK2Q8IWU2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
LMTK2Q8IWU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
LMTK2Q8IWU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
LMTK2Q8IWU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
LMTK2Q8IWU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
LMTK2Q8IWU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
LMTK2Q8IWU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
LMTK2Q8IWU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
LMTK2Q8IWU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
LMTK2Q8IWU2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
LMTK2Q8IWU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
LMTK2Q8IWU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
LMTK2Q8IWU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
LMTK2Q8IWU2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
LMTK2Q8IWU2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
LMTK2Q8IWU2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
LMTK2Q8IWU2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
LMTK2Q8IWU2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
LMTK2Q8IWU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
LMTK2Q8IWU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
LMTK2Q8IWU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
LMTK2Q8IWU2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
LMTK2Q8IWU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
LMTK2Q8IWU2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
LMTK2Q8IWU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
LMTK2Q8IWU2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
LMTK2Q8IWU2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
LMTK2Q8IWU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
LMTK2Q8IWU2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
LMTK2Q8IWU2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
LMTK2Q8IWU2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
LMTK2Q8IWU2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
LMTK2Q8IWU2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
LMTK2Q8IWU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms