Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWJ2

GCC2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC2Q8IWJ2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.5■■■■■ 5.84
GCC2Q8IWJ2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
GCC2Q8IWJ2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
GCC2Q8IWJ2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
GCC2Q8IWJ2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.99■■■■■ 5.59
GCC2Q8IWJ2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
GCC2Q8IWJ2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.88■■■■■ 5.57
GCC2Q8IWJ2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.49■■■■■ 5.51
GCC2Q8IWJ2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.97■■■■■ 5.43
GCC2Q8IWJ2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
GCC2Q8IWJ2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
GCC2Q8IWJ2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
GCC2Q8IWJ2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
GCC2Q8IWJ2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
GCC2Q8IWJ2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
GCC2Q8IWJ2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
GCC2Q8IWJ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
GCC2Q8IWJ2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
GCC2Q8IWJ2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
GCC2Q8IWJ2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
GCC2Q8IWJ2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
GCC2Q8IWJ2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
GCC2Q8IWJ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
GCC2Q8IWJ2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
GCC2Q8IWJ2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
GCC2Q8IWJ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
GCC2Q8IWJ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
GCC2Q8IWJ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
GCC2Q8IWJ2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
GCC2Q8IWJ2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
GCC2Q8IWJ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
GCC2Q8IWJ2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
GCC2Q8IWJ2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
GCC2Q8IWJ2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
GCC2Q8IWJ2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
GCC2Q8IWJ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
GCC2Q8IWJ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
GCC2Q8IWJ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
GCC2Q8IWJ2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
GCC2Q8IWJ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
GCC2Q8IWJ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.72■■■■■ 4.91
GCC2Q8IWJ2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.91
GCC2Q8IWJ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
GCC2Q8IWJ2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
GCC2Q8IWJ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
GCC2Q8IWJ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
GCC2Q8IWJ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
GCC2Q8IWJ2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
GCC2Q8IWJ2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
GCC2Q8IWJ2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
GCC2Q8IWJ2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
GCC2Q8IWJ2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
GCC2Q8IWJ2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
GCC2Q8IWJ2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
GCC2Q8IWJ2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
GCC2Q8IWJ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
GCC2Q8IWJ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
GCC2Q8IWJ2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
GCC2Q8IWJ2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
GCC2Q8IWJ2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
GCC2Q8IWJ2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
GCC2Q8IWJ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
GCC2Q8IWJ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
GCC2Q8IWJ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
GCC2Q8IWJ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
GCC2Q8IWJ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
GCC2Q8IWJ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
GCC2Q8IWJ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
GCC2Q8IWJ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
GCC2Q8IWJ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
GCC2Q8IWJ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
GCC2Q8IWJ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
GCC2Q8IWJ2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
GCC2Q8IWJ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
GCC2Q8IWJ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
GCC2Q8IWJ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
GCC2Q8IWJ2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
GCC2Q8IWJ2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
GCC2Q8IWJ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
GCC2Q8IWJ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
GCC2Q8IWJ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GCC2Q8IWJ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
GCC2Q8IWJ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
GCC2Q8IWJ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
GCC2Q8IWJ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
GCC2Q8IWJ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
GCC2Q8IWJ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
GCC2Q8IWJ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
GCC2Q8IWJ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
GCC2Q8IWJ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
GCC2Q8IWJ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
GCC2Q8IWJ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
GCC2Q8IWJ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
GCC2Q8IWJ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms