Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.67■■■■■ 6.5
P3H3Q8IVL6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.76■■■■■ 6.36
P3H3Q8IVL6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
P3H3Q8IVL6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.03■■■■■ 6.24
P3H3Q8IVL6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.81■■■■■ 6.2
P3H3Q8IVL6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.58■■■■■ 6.17
P3H3Q8IVL6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
P3H3Q8IVL6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.23■■■■■ 6.11
P3H3Q8IVL6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
P3H3Q8IVL6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.26■■■■■ 5.96
P3H3Q8IVL6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.25■■■■■ 5.95
P3H3Q8IVL6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.18■■■■■ 5.94
P3H3Q8IVL6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
P3H3Q8IVL6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
P3H3Q8IVL6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
P3H3Q8IVL6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.83■■■■■ 5.89
P3H3Q8IVL6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
P3H3Q8IVL6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
P3H3Q8IVL6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
P3H3Q8IVL6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
P3H3Q8IVL6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.07■■■■■ 5.77
P3H3Q8IVL6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
P3H3Q8IVL6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
P3H3Q8IVL6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
P3H3Q8IVL6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
P3H3Q8IVL6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.79■■■■■ 5.72
P3H3Q8IVL6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.73■■■■■ 5.71
P3H3Q8IVL6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
P3H3Q8IVL6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
P3H3Q8IVL6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
P3H3Q8IVL6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
P3H3Q8IVL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.28■■■■■ 5.64
P3H3Q8IVL6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
P3H3Q8IVL6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.86■■■■■ 5.57
P3H3Q8IVL6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.8■■■■■ 5.56
P3H3Q8IVL6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.79■■■■■ 5.56
P3H3Q8IVL6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.79■■■■■ 5.56
P3H3Q8IVL6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.63■■■■■ 5.54
P3H3Q8IVL6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
P3H3Q8IVL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
P3H3Q8IVL6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
P3H3Q8IVL6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
P3H3Q8IVL6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
P3H3Q8IVL6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
P3H3Q8IVL6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
P3H3Q8IVL6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
P3H3Q8IVL6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
P3H3Q8IVL6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
P3H3Q8IVL6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
P3H3Q8IVL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
P3H3Q8IVL6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
P3H3Q8IVL6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
P3H3Q8IVL6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
P3H3Q8IVL6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
P3H3Q8IVL6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
P3H3Q8IVL6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
P3H3Q8IVL6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
P3H3Q8IVL6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
P3H3Q8IVL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
P3H3Q8IVL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
P3H3Q8IVL6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.3
P3H3Q8IVL6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.19■■■■■ 5.3
P3H3Q8IVL6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
P3H3Q8IVL6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
P3H3Q8IVL6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
P3H3Q8IVL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
P3H3Q8IVL6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
P3H3Q8IVL6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
P3H3Q8IVL6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
P3H3Q8IVL6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
P3H3Q8IVL6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.91■■■■■ 5.26
P3H3Q8IVL6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
P3H3Q8IVL6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.86■■■■■ 5.25
P3H3Q8IVL6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
P3H3Q8IVL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
P3H3Q8IVL6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
P3H3Q8IVL6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
P3H3Q8IVL6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
P3H3Q8IVL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.75■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
P3H3Q8IVL6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
P3H3Q8IVL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
P3H3Q8IVL6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
P3H3Q8IVL6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
P3H3Q8IVL6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
P3H3Q8IVL6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
P3H3Q8IVL6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
P3H3Q8IVL6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
P3H3Q8IVL6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
P3H3Q8IVL6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
P3H3Q8IVL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
P3H3Q8IVL6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.26■■■■■ 5.16
P3H3Q8IVL6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
P3H3Q8IVL6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
P3H3Q8IVL6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms