Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYT12Q8IV01 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYT12Q8IV01 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYT12Q8IV01 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYT12Q8IV01 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYT12Q8IV01 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SYT12Q8IV01 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYT12Q8IV01 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYT12Q8IV01 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SYT12Q8IV01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYT12Q8IV01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYT12Q8IV01 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYT12Q8IV01 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYT12Q8IV01 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYT12Q8IV01 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYT12Q8IV01 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYT12Q8IV01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYT12Q8IV01 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SYT12Q8IV01 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYT12Q8IV01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYT12Q8IV01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYT12Q8IV01 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYT12Q8IV01 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYT12Q8IV01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYT12Q8IV01 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYT12Q8IV01 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYT12Q8IV01 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SYT12Q8IV01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYT12Q8IV01 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYT12Q8IV01 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYT12Q8IV01 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYT12Q8IV01 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYT12Q8IV01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SYT12Q8IV01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SYT12Q8IV01 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYT12Q8IV01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYT12Q8IV01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYT12Q8IV01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYT12Q8IV01 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT12Q8IV01 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYT12Q8IV01 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYT12Q8IV01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT12Q8IV01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYT12Q8IV01 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYT12Q8IV01 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYT12Q8IV01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYT12Q8IV01 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYT12Q8IV01 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYT12Q8IV01 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYT12Q8IV01 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYT12Q8IV01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYT12Q8IV01 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYT12Q8IV01 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYT12Q8IV01 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYT12Q8IV01 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYT12Q8IV01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYT12Q8IV01 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYT12Q8IV01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYT12Q8IV01 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYT12Q8IV01 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYT12Q8IV01 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYT12Q8IV01 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYT12Q8IV01 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT12Q8IV01 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYT12Q8IV01 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYT12Q8IV01 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT12Q8IV01 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYT12Q8IV01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT12Q8IV01 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT12Q8IV01 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT12Q8IV01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT12Q8IV01 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYT12Q8IV01 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYT12Q8IV01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT12Q8IV01 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT12Q8IV01 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYT12Q8IV01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT12Q8IV01 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT12Q8IV01 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT12Q8IV01 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT12Q8IV01 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT12Q8IV01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT12Q8IV01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYT12Q8IV01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT12Q8IV01 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYT12Q8IV01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT12Q8IV01 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT12Q8IV01 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYT12Q8IV01 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms