Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
IFNL1Q8IU54 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
IFNL1Q8IU54 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
IFNL1Q8IU54 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
IFNL1Q8IU54 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
IFNL1Q8IU54 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
IFNL1Q8IU54 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
IFNL1Q8IU54 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
IFNL1Q8IU54 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
IFNL1Q8IU54 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
IFNL1Q8IU54 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IFNL1Q8IU54 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
IFNL1Q8IU54 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
IFNL1Q8IU54 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
IFNL1Q8IU54 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
IFNL1Q8IU54 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFNL1Q8IU54 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFNL1Q8IU54 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFNL1Q8IU54 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFNL1Q8IU54 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFNL1Q8IU54 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
IFNL1Q8IU54 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFNL1Q8IU54 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IFNL1Q8IU54 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IFNL1Q8IU54 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
IFNL1Q8IU54 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFNL1Q8IU54 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFNL1Q8IU54 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFNL1Q8IU54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
IFNL1Q8IU54 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
IFNL1Q8IU54 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IFNL1Q8IU54 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
IFNL1Q8IU54 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFNL1Q8IU54 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFNL1Q8IU54 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFNL1Q8IU54 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
IFNL1Q8IU54 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFNL1Q8IU54 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFNL1Q8IU54 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFNL1Q8IU54 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFNL1Q8IU54 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
IFNL1Q8IU54 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFNL1Q8IU54 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFNL1Q8IU54 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFNL1Q8IU54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFNL1Q8IU54 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFNL1Q8IU54 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFNL1Q8IU54 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IFNL1Q8IU54 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFNL1Q8IU54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFNL1Q8IU54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
IFNL1Q8IU54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFNL1Q8IU54 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFNL1Q8IU54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFNL1Q8IU54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFNL1Q8IU54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFNL1Q8IU54 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFNL1Q8IU54 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IFNL1Q8IU54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFNL1Q8IU54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFNL1Q8IU54 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IFNL1Q8IU54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IFNL1Q8IU54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
IFNL1Q8IU54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
IFNL1Q8IU54 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IFNL1Q8IU54 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
IFNL1Q8IU54 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IFNL1Q8IU54 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IFNL1Q8IU54 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFNL1Q8IU54 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IFNL1Q8IU54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
IFNL1Q8IU54 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IFNL1Q8IU54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFNL1Q8IU54 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFNL1Q8IU54 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFNL1Q8IU54 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
IFNL1Q8IU54 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
IFNL1Q8IU54 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFNL1Q8IU54 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFNL1Q8IU54 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFNL1Q8IU54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
IFNL1Q8IU54 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms