Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.67
NPM2Q86SE8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
NPM2Q86SE8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NPM2Q86SE8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NPM2Q86SE8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NPM2Q86SE8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NPM2Q86SE8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NPM2Q86SE8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
NPM2Q86SE8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NPM2Q86SE8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NPM2Q86SE8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NPM2Q86SE8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NPM2Q86SE8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NPM2Q86SE8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NPM2Q86SE8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
NPM2Q86SE8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NPM2Q86SE8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NPM2Q86SE8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NPM2Q86SE8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NPM2Q86SE8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NPM2Q86SE8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NPM2Q86SE8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NPM2Q86SE8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NPM2Q86SE8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NPM2Q86SE8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NPM2Q86SE8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NPM2Q86SE8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NPM2Q86SE8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NPM2Q86SE8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NPM2Q86SE8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NPM2Q86SE8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NPM2Q86SE8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NPM2Q86SE8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NPM2Q86SE8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NPM2Q86SE8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
NPM2Q86SE8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NPM2Q86SE8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NPM2Q86SE8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NPM2Q86SE8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NPM2Q86SE8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
NPM2Q86SE8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NPM2Q86SE8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NPM2Q86SE8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NPM2Q86SE8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NPM2Q86SE8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
NPM2Q86SE8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NPM2Q86SE8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NPM2Q86SE8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NPM2Q86SE8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NPM2Q86SE8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NPM2Q86SE8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NPM2Q86SE8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NPM2Q86SE8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NPM2Q86SE8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NPM2Q86SE8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NPM2Q86SE8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NPM2Q86SE8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NPM2Q86SE8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NPM2Q86SE8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NPM2Q86SE8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.82
NPM2Q86SE8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NPM2Q86SE8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NPM2Q86SE8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
NPM2Q86SE8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NPM2Q86SE8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NPM2Q86SE8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NPM2Q86SE8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NPM2Q86SE8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NPM2Q86SE8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NPM2Q86SE8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NPM2Q86SE8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NPM2Q86SE8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NPM2Q86SE8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NPM2Q86SE8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NPM2Q86SE8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NPM2Q86SE8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NPM2Q86SE8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NPM2Q86SE8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NPM2Q86SE8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NPM2Q86SE8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NPM2Q86SE8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NPM2Q86SE8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NPM2Q86SE8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NPM2Q86SE8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NPM2Q86SE8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NPM2Q86SE8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NPM2Q86SE8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NPM2Q86SE8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NPM2Q86SE8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NPM2Q86SE8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms