Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NPM2Q86SE8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NPM2Q86SE8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NPM2Q86SE8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NPM2Q86SE8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NPM2Q86SE8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NPM2Q86SE8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NPM2Q86SE8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NPM2Q86SE8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NPM2Q86SE8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NPM2Q86SE8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NPM2Q86SE8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NPM2Q86SE8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NPM2Q86SE8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPM2Q86SE8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NPM2Q86SE8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NPM2Q86SE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NPM2Q86SE8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NPM2Q86SE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPM2Q86SE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NPM2Q86SE8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPM2Q86SE8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NPM2Q86SE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NPM2Q86SE8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPM2Q86SE8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NPM2Q86SE8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPM2Q86SE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NPM2Q86SE8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NPM2Q86SE8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms