Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L0

VMO1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1Q7Z5L0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VMO1Q7Z5L0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VMO1Q7Z5L0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VMO1Q7Z5L0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VMO1Q7Z5L0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VMO1Q7Z5L0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VMO1Q7Z5L0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VMO1Q7Z5L0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VMO1Q7Z5L0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VMO1Q7Z5L0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VMO1Q7Z5L0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VMO1Q7Z5L0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VMO1Q7Z5L0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VMO1Q7Z5L0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VMO1Q7Z5L0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VMO1Q7Z5L0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VMO1Q7Z5L0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VMO1Q7Z5L0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VMO1Q7Z5L0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VMO1Q7Z5L0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VMO1Q7Z5L0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VMO1Q7Z5L0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VMO1Q7Z5L0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VMO1Q7Z5L0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VMO1Q7Z5L0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VMO1Q7Z5L0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VMO1Q7Z5L0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VMO1Q7Z5L0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VMO1Q7Z5L0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VMO1Q7Z5L0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VMO1Q7Z5L0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VMO1Q7Z5L0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VMO1Q7Z5L0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VMO1Q7Z5L0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VMO1Q7Z5L0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VMO1Q7Z5L0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VMO1Q7Z5L0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VMO1Q7Z5L0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VMO1Q7Z5L0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VMO1Q7Z5L0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VMO1Q7Z5L0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VMO1Q7Z5L0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VMO1Q7Z5L0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VMO1Q7Z5L0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VMO1Q7Z5L0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VMO1Q7Z5L0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VMO1Q7Z5L0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VMO1Q7Z5L0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VMO1Q7Z5L0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VMO1Q7Z5L0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMO1Q7Z5L0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VMO1Q7Z5L0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VMO1Q7Z5L0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VMO1Q7Z5L0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VMO1Q7Z5L0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VMO1Q7Z5L0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VMO1Q7Z5L0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VMO1Q7Z5L0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VMO1Q7Z5L0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VMO1Q7Z5L0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VMO1Q7Z5L0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VMO1Q7Z5L0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VMO1Q7Z5L0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMO1Q7Z5L0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VMO1Q7Z5L0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMO1Q7Z5L0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMO1Q7Z5L0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VMO1Q7Z5L0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VMO1Q7Z5L0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VMO1Q7Z5L0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VMO1Q7Z5L0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VMO1Q7Z5L0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VMO1Q7Z5L0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMO1Q7Z5L0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VMO1Q7Z5L0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMO1Q7Z5L0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VMO1Q7Z5L0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VMO1Q7Z5L0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms