Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.55■■■■■ 6.8
CLASP1Q7Z460 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC56.92■■■■■ 6.7
CLASP1Q7Z460 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.91■■■■■ 6.7
CLASP1Q7Z460 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.82■■■■■ 6.53
CLASP1Q7Z460 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
CLASP1Q7Z460 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.02■■■■■ 6.4
CLASP1Q7Z460 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
CLASP1Q7Z460 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.86■■■■■ 6.37
CLASP1Q7Z460 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.85■■■■■ 6.37
CLASP1Q7Z460 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC54.82■■■■■ 6.37
CLASP1Q7Z460 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC54.36■■■■■ 6.29
CLASP1Q7Z460 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.29■■■■■ 6.28
CLASP1Q7Z460 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.18■■■■■ 6.26
CLASP1Q7Z460 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
CLASP1Q7Z460 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.02■■■■■ 6.24
CLASP1Q7Z460 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.94■■■■■ 6.22
CLASP1Q7Z460 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.56■■■■■ 6.16
CLASP1Q7Z460 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
CLASP1Q7Z460 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
CLASP1Q7Z460 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
CLASP1Q7Z460 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
CLASP1Q7Z460 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.02■■■■■ 6.08
CLASP1Q7Z460 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.01■■■■■ 6.08
CLASP1Q7Z460 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
CLASP1Q7Z460 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.84■■■■■ 6.05
CLASP1Q7Z460 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.84■■■■■ 6.05
CLASP1Q7Z460 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.72■■■■■ 6.03
CLASP1Q7Z460 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.65■■■■■ 6.02
CLASP1Q7Z460 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.56■■■■■ 6.01
CLASP1Q7Z460 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
CLASP1Q7Z460 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.36■■■■■ 5.97
CLASP1Q7Z460 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.2■■■■■ 5.95
CLASP1Q7Z460 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
CLASP1Q7Z460 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
CLASP1Q7Z460 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.75■■■■■ 5.88
CLASP1Q7Z460 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.61■■■■■ 5.85
CLASP1Q7Z460 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.38■■■■■ 5.82
CLASP1Q7Z460 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
CLASP1Q7Z460 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
CLASP1Q7Z460 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.12■■■■■ 5.77
CLASP1Q7Z460 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
CLASP1Q7Z460 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
CLASP1Q7Z460 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
CLASP1Q7Z460 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
CLASP1Q7Z460 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
CLASP1Q7Z460 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
CLASP1Q7Z460 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.82■■■■■ 5.73
CLASP1Q7Z460 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
CLASP1Q7Z460 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CLASP1Q7Z460 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.68■■■■■ 5.7
CLASP1Q7Z460 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CLASP1Q7Z460 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
CLASP1Q7Z460 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.62■■■■■ 5.69
CLASP1Q7Z460 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
CLASP1Q7Z460 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
CLASP1Q7Z460 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
CLASP1Q7Z460 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.44■■■■■ 5.67
CLASP1Q7Z460 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
CLASP1Q7Z460 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.42■■■■■ 5.66
CLASP1Q7Z460 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CLASP1Q7Z460 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
CLASP1Q7Z460 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
CLASP1Q7Z460 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
CLASP1Q7Z460 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CLASP1Q7Z460 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
CLASP1Q7Z460 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
CLASP1Q7Z460 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
CLASP1Q7Z460 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
CLASP1Q7Z460 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
CLASP1Q7Z460 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
CLASP1Q7Z460 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
CLASP1Q7Z460 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.79■■■■■ 5.56
CLASP1Q7Z460 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
CLASP1Q7Z460 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
CLASP1Q7Z460 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.74■■■■■ 5.55
CLASP1Q7Z460 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
CLASP1Q7Z460 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
CLASP1Q7Z460 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
CLASP1Q7Z460 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
CLASP1Q7Z460 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
CLASP1Q7Z460 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CLASP1Q7Z460 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CLASP1Q7Z460 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CLASP1Q7Z460 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CLASP1Q7Z460 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
CLASP1Q7Z460 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
CLASP1Q7Z460 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.51
CLASP1Q7Z460 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
CLASP1Q7Z460 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CLASP1Q7Z460 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
CLASP1Q7Z460 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.45■■■■■ 5.51
CLASP1Q7Z460 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
CLASP1Q7Z460 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
CLASP1Q7Z460 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
CLASP1Q7Z460 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
CLASP1Q7Z460 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
CLASP1Q7Z460 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
CLASP1Q7Z460 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CLASP1Q7Z460 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.27■■■■■ 5.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms