Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.19■■■■■ 5.46
CLASP1Q7Z460 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.15■■■■■ 5.46
CLASP1Q7Z460 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.88■■■■■ 5.41
CLASP1Q7Z460 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
CLASP1Q7Z460 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
CLASP1Q7Z460 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
CLASP1Q7Z460 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
CLASP1Q7Z460 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC48.62■■■■■ 5.37
CLASP1Q7Z460 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
CLASP1Q7Z460 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CLASP1Q7Z460 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CLASP1Q7Z460 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.02■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.97■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CLASP1Q7Z460 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
CLASP1Q7Z460 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
CLASP1Q7Z460 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CLASP1Q7Z460 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CLASP1Q7Z460 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CLASP1Q7Z460 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CLASP1Q7Z460 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CLASP1Q7Z460 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms