Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KRT25Q7Z3Z0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KRT25Q7Z3Z0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
KRT25Q7Z3Z0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KRT25Q7Z3Z0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KRT25Q7Z3Z0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KRT25Q7Z3Z0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KRT25Q7Z3Z0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KRT25Q7Z3Z0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KRT25Q7Z3Z0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KRT25Q7Z3Z0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KRT25Q7Z3Z0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KRT25Q7Z3Z0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KRT25Q7Z3Z0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KRT25Q7Z3Z0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KRT25Q7Z3Z0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KRT25Q7Z3Z0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KRT25Q7Z3Z0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KRT25Q7Z3Z0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KRT25Q7Z3Z0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KRT25Q7Z3Z0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KRT25Q7Z3Z0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KRT25Q7Z3Z0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KRT25Q7Z3Z0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT25Q7Z3Z0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KRT25Q7Z3Z0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KRT25Q7Z3Z0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KRT25Q7Z3Z0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KRT25Q7Z3Z0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KRT25Q7Z3Z0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KRT25Q7Z3Z0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KRT25Q7Z3Z0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KRT25Q7Z3Z0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT25Q7Z3Z0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT25Q7Z3Z0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT25Q7Z3Z0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT25Q7Z3Z0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KRT25Q7Z3Z0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KRT25Q7Z3Z0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT25Q7Z3Z0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT25Q7Z3Z0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KRT25Q7Z3Z0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT25Q7Z3Z0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KRT25Q7Z3Z0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT25Q7Z3Z0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT25Q7Z3Z0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT25Q7Z3Z0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT25Q7Z3Z0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT25Q7Z3Z0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KRT25Q7Z3Z0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KRT25Q7Z3Z0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KRT25Q7Z3Z0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KRT25Q7Z3Z0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KRT25Q7Z3Z0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KRT25Q7Z3Z0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KRT25Q7Z3Z0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT25Q7Z3Z0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT25Q7Z3Z0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT25Q7Z3Z0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT25Q7Z3Z0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT25Q7Z3Z0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KRT25Q7Z3Z0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT25Q7Z3Z0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT25Q7Z3Z0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KRT25Q7Z3Z0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KRT25Q7Z3Z0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT25Q7Z3Z0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT25Q7Z3Z0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT25Q7Z3Z0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT25Q7Z3Z0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KRT25Q7Z3Z0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KRT25Q7Z3Z0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT25Q7Z3Z0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KRT25Q7Z3Z0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KRT25Q7Z3Z0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT25Q7Z3Z0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT25Q7Z3Z0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT25Q7Z3Z0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT25Q7Z3Z0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KRT25Q7Z3Z0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KRT25Q7Z3Z0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KRT25Q7Z3Z0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KRT25Q7Z3Z0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KRT25Q7Z3Z0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KRT25Q7Z3Z0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KRT25Q7Z3Z0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KRT25Q7Z3Z0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KRT25Q7Z3Z0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KRT25Q7Z3Z0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KRT25Q7Z3Z0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KRT25Q7Z3Z0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KRT25Q7Z3Z0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms