Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TFAP2EQ6VUC0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TFAP2EQ6VUC0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFAP2EQ6VUC0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFAP2EQ6VUC0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TFAP2EQ6VUC0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TFAP2EQ6VUC0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFAP2EQ6VUC0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP2EQ6VUC0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TFAP2EQ6VUC0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAP2EQ6VUC0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP2EQ6VUC0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP2EQ6VUC0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFAP2EQ6VUC0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFAP2EQ6VUC0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP2EQ6VUC0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP2EQ6VUC0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFAP2EQ6VUC0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP2EQ6VUC0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFAP2EQ6VUC0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP2EQ6VUC0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFAP2EQ6VUC0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP2EQ6VUC0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP2EQ6VUC0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFAP2EQ6VUC0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP2EQ6VUC0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFAP2EQ6VUC0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP2EQ6VUC0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP2EQ6VUC0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP2EQ6VUC0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP2EQ6VUC0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP2EQ6VUC0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAP2EQ6VUC0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP2EQ6VUC0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAP2EQ6VUC0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP2EQ6VUC0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP2EQ6VUC0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP2EQ6VUC0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP2EQ6VUC0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP2EQ6VUC0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFAP2EQ6VUC0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP2EQ6VUC0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAP2EQ6VUC0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP2EQ6VUC0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TFAP2EQ6VUC0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP2EQ6VUC0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP2EQ6VUC0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP2EQ6VUC0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP2EQ6VUC0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TFAP2EQ6VUC0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP2EQ6VUC0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP2EQ6VUC0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP2EQ6VUC0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP2EQ6VUC0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TFAP2EQ6VUC0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP2EQ6VUC0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP2EQ6VUC0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP2EQ6VUC0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP2EQ6VUC0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAP2EQ6VUC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAP2EQ6VUC0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP2EQ6VUC0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP2EQ6VUC0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP2EQ6VUC0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP2EQ6VUC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP2EQ6VUC0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFAP2EQ6VUC0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFAP2EQ6VUC0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP2EQ6VUC0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP2EQ6VUC0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFAP2EQ6VUC0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP2EQ6VUC0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP2EQ6VUC0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAP2EQ6VUC0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP2EQ6VUC0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP2EQ6VUC0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP2EQ6VUC0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP2EQ6VUC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP2EQ6VUC0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP2EQ6VUC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP2EQ6VUC0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP2EQ6VUC0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP2EQ6VUC0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAP2EQ6VUC0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAP2EQ6VUC0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAP2EQ6VUC0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAP2EQ6VUC0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAP2EQ6VUC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 702.6 ms