Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
OPN5Q6U736 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
OPN5Q6U736 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
OPN5Q6U736 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
OPN5Q6U736 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
OPN5Q6U736 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
OPN5Q6U736 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
OPN5Q6U736 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
OPN5Q6U736 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
OPN5Q6U736 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
OPN5Q6U736 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPN5Q6U736 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OPN5Q6U736 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OPN5Q6U736 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OPN5Q6U736 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OPN5Q6U736 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OPN5Q6U736 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OPN5Q6U736 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
OPN5Q6U736 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
OPN5Q6U736 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OPN5Q6U736 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPN5Q6U736 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
OPN5Q6U736 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OPN5Q6U736 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OPN5Q6U736 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OPN5Q6U736 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPN5Q6U736 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPN5Q6U736 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPN5Q6U736 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPN5Q6U736 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OPN5Q6U736 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OPN5Q6U736 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OPN5Q6U736 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OPN5Q6U736 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OPN5Q6U736 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OPN5Q6U736 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OPN5Q6U736 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OPN5Q6U736 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OPN5Q6U736 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OPN5Q6U736 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OPN5Q6U736 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OPN5Q6U736 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
OPN5Q6U736 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OPN5Q6U736 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OPN5Q6U736 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OPN5Q6U736 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
OPN5Q6U736 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OPN5Q6U736 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OPN5Q6U736 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OPN5Q6U736 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OPN5Q6U736 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OPN5Q6U736 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OPN5Q6U736 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
OPN5Q6U736 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OPN5Q6U736 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPN5Q6U736 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OPN5Q6U736 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OPN5Q6U736 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OPN5Q6U736 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPN5Q6U736 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPN5Q6U736 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPN5Q6U736 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPN5Q6U736 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPN5Q6U736 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPN5Q6U736 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OPN5Q6U736 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPN5Q6U736 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPN5Q6U736 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPN5Q6U736 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OPN5Q6U736 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPN5Q6U736 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPN5Q6U736 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPN5Q6U736 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPN5Q6U736 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPN5Q6U736 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPN5Q6U736 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPN5Q6U736 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPN5Q6U736 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPN5Q6U736 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPN5Q6U736 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OPN5Q6U736 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OPN5Q6U736 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OPN5Q6U736 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OPN5Q6U736 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OPN5Q6U736 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OPN5Q6U736 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OPN5Q6U736 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPN5Q6U736 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPN5Q6U736 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPN5Q6U736 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPN5Q6U736 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPN5Q6U736 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPN5Q6U736 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms