Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRAF7Q6Q0C0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRAF7Q6Q0C0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAF7Q6Q0C0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRAF7Q6Q0C0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRAF7Q6Q0C0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAF7Q6Q0C0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRAF7Q6Q0C0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAF7Q6Q0C0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAF7Q6Q0C0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRAF7Q6Q0C0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAF7Q6Q0C0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAF7Q6Q0C0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAF7Q6Q0C0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAF7Q6Q0C0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAF7Q6Q0C0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRAF7Q6Q0C0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRAF7Q6Q0C0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAF7Q6Q0C0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRAF7Q6Q0C0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAF7Q6Q0C0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAF7Q6Q0C0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAF7Q6Q0C0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAF7Q6Q0C0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAF7Q6Q0C0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAF7Q6Q0C0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAF7Q6Q0C0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRAF7Q6Q0C0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRAF7Q6Q0C0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAF7Q6Q0C0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAF7Q6Q0C0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRAF7Q6Q0C0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAF7Q6Q0C0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRAF7Q6Q0C0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRAF7Q6Q0C0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAF7Q6Q0C0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRAF7Q6Q0C0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRAF7Q6Q0C0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAF7Q6Q0C0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAF7Q6Q0C0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRAF7Q6Q0C0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRAF7Q6Q0C0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRAF7Q6Q0C0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRAF7Q6Q0C0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAF7Q6Q0C0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRAF7Q6Q0C0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRAF7Q6Q0C0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAF7Q6Q0C0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRAF7Q6Q0C0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAF7Q6Q0C0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRAF7Q6Q0C0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRAF7Q6Q0C0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAF7Q6Q0C0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAF7Q6Q0C0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAF7Q6Q0C0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAF7Q6Q0C0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAF7Q6Q0C0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAF7Q6Q0C0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAF7Q6Q0C0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAF7Q6Q0C0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRAF7Q6Q0C0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRAF7Q6Q0C0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRAF7Q6Q0C0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAF7Q6Q0C0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAF7Q6Q0C0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRAF7Q6Q0C0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms