Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RALGAPA1Q6GYQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RALGAPA1Q6GYQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RALGAPA1Q6GYQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
RALGAPA1Q6GYQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RALGAPA1Q6GYQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RALGAPA1Q6GYQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RALGAPA1Q6GYQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RALGAPA1Q6GYQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RALGAPA1Q6GYQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RALGAPA1Q6GYQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RALGAPA1Q6GYQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RALGAPA1Q6GYQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RALGAPA1Q6GYQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RALGAPA1Q6GYQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RALGAPA1Q6GYQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RALGAPA1Q6GYQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RALGAPA1Q6GYQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RALGAPA1Q6GYQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RALGAPA1Q6GYQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RALGAPA1Q6GYQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RALGAPA1Q6GYQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RALGAPA1Q6GYQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RALGAPA1Q6GYQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RALGAPA1Q6GYQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RALGAPA1Q6GYQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RALGAPA1Q6GYQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
RALGAPA1Q6GYQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RALGAPA1Q6GYQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RALGAPA1Q6GYQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RALGAPA1Q6GYQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RALGAPA1Q6GYQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RALGAPA1Q6GYQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RALGAPA1Q6GYQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RALGAPA1Q6GYQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RALGAPA1Q6GYQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RALGAPA1Q6GYQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RALGAPA1Q6GYQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RALGAPA1Q6GYQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RALGAPA1Q6GYQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RALGAPA1Q6GYQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RALGAPA1Q6GYQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RALGAPA1Q6GYQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RALGAPA1Q6GYQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RALGAPA1Q6GYQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RALGAPA1Q6GYQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RALGAPA1Q6GYQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RALGAPA1Q6GYQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms