Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDS2

UHRF1BP1, UHRF1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1BP1Q6BDS2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.51■■■■■ 5.84
UHRF1BP1Q6BDS2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.94■■■■■ 5.74
UHRF1BP1Q6BDS2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.83■■■■■ 5.73
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
UHRF1BP1Q6BDS2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
UHRF1BP1Q6BDS2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
UHRF1BP1Q6BDS2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
UHRF1BP1Q6BDS2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
UHRF1BP1Q6BDS2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
UHRF1BP1Q6BDS2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
UHRF1BP1Q6BDS2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.46■■■■■ 5.35
UHRF1BP1Q6BDS2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
UHRF1BP1Q6BDS2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
UHRF1BP1Q6BDS2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
UHRF1BP1Q6BDS2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
UHRF1BP1Q6BDS2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
UHRF1BP1Q6BDS2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
UHRF1BP1Q6BDS2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
UHRF1BP1Q6BDS2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
UHRF1BP1Q6BDS2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
UHRF1BP1Q6BDS2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
UHRF1BP1Q6BDS2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
UHRF1BP1Q6BDS2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
UHRF1BP1Q6BDS2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
UHRF1BP1Q6BDS2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
UHRF1BP1Q6BDS2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
UHRF1BP1Q6BDS2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.04■■■■■ 5.12
UHRF1BP1Q6BDS2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
UHRF1BP1Q6BDS2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
UHRF1BP1Q6BDS2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
UHRF1BP1Q6BDS2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
UHRF1BP1Q6BDS2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
UHRF1BP1Q6BDS2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
UHRF1BP1Q6BDS2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
UHRF1BP1Q6BDS2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.27■■■■■ 5
UHRF1BP1Q6BDS2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
UHRF1BP1Q6BDS2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
UHRF1BP1Q6BDS2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
UHRF1BP1Q6BDS2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
UHRF1BP1Q6BDS2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
UHRF1BP1Q6BDS2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
UHRF1BP1Q6BDS2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
UHRF1BP1Q6BDS2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
UHRF1BP1Q6BDS2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
UHRF1BP1Q6BDS2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.51■■■■■ 4.88
UHRF1BP1Q6BDS2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
UHRF1BP1Q6BDS2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
UHRF1BP1Q6BDS2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
UHRF1BP1Q6BDS2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
UHRF1BP1Q6BDS2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
UHRF1BP1Q6BDS2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
UHRF1BP1Q6BDS2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
UHRF1BP1Q6BDS2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
UHRF1BP1Q6BDS2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
UHRF1BP1Q6BDS2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
UHRF1BP1Q6BDS2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
UHRF1BP1Q6BDS2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
UHRF1BP1Q6BDS2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
UHRF1BP1Q6BDS2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
UHRF1BP1Q6BDS2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
UHRF1BP1Q6BDS2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
UHRF1BP1Q6BDS2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
UHRF1BP1Q6BDS2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
UHRF1BP1Q6BDS2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
UHRF1BP1Q6BDS2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
UHRF1BP1Q6BDS2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
UHRF1BP1Q6BDS2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
UHRF1BP1Q6BDS2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
UHRF1BP1Q6BDS2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
UHRF1BP1Q6BDS2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
UHRF1BP1Q6BDS2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
UHRF1BP1Q6BDS2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
UHRF1BP1Q6BDS2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
UHRF1BP1Q6BDS2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
UHRF1BP1Q6BDS2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
UHRF1BP1Q6BDS2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
UHRF1BP1Q6BDS2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
UHRF1BP1Q6BDS2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
UHRF1BP1Q6BDS2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
UHRF1BP1Q6BDS2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
UHRF1BP1Q6BDS2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
UHRF1BP1Q6BDS2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
UHRF1BP1Q6BDS2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
UHRF1BP1Q6BDS2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
UHRF1BP1Q6BDS2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms