Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUSC1-AS1Q66K80 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUSC1-AS1Q66K80 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUSC1-AS1Q66K80 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUSC1-AS1Q66K80 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUSC1-AS1Q66K80 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUSC1-AS1Q66K80 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RUSC1-AS1Q66K80 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUSC1-AS1Q66K80 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUSC1-AS1Q66K80 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUSC1-AS1Q66K80 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1Q66K80 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUSC1-AS1Q66K80 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1Q66K80 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUSC1-AS1Q66K80 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1Q66K80 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUSC1-AS1Q66K80 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1Q66K80 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUSC1-AS1Q66K80 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUSC1-AS1Q66K80 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUSC1-AS1Q66K80 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1Q66K80 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1Q66K80 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1-AS1Q66K80 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1-AS1Q66K80 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUSC1-AS1Q66K80 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUSC1-AS1Q66K80 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUSC1-AS1Q66K80 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUSC1-AS1Q66K80 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUSC1-AS1Q66K80 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUSC1-AS1Q66K80 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUSC1-AS1Q66K80 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUSC1-AS1Q66K80 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUSC1-AS1Q66K80 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUSC1-AS1Q66K80 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUSC1-AS1Q66K80 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUSC1-AS1Q66K80 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUSC1-AS1Q66K80 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUSC1-AS1Q66K80 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUSC1-AS1Q66K80 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUSC1-AS1Q66K80 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1-AS1Q66K80 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1-AS1Q66K80 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1-AS1Q66K80 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1-AS1Q66K80 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUSC1-AS1Q66K80 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUSC1-AS1Q66K80 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUSC1-AS1Q66K80 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUSC1-AS1Q66K80 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RUSC1-AS1Q66K80 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUSC1-AS1Q66K80 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUSC1-AS1Q66K80 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUSC1-AS1Q66K80 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUSC1-AS1Q66K80 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUSC1-AS1Q66K80 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUSC1-AS1Q66K80 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUSC1-AS1Q66K80 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUSC1-AS1Q66K80 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1-AS1Q66K80 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1-AS1Q66K80 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1-AS1Q66K80 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1-AS1Q66K80 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1-AS1Q66K80 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1-AS1Q66K80 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUSC1-AS1Q66K80 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUSC1-AS1Q66K80 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUSC1-AS1Q66K80 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUSC1-AS1Q66K80 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUSC1-AS1Q66K80 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUSC1-AS1Q66K80 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUSC1-AS1Q66K80 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUSC1-AS1Q66K80 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUSC1-AS1Q66K80 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUSC1-AS1Q66K80 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUSC1-AS1Q66K80 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUSC1-AS1Q66K80 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUSC1-AS1Q66K80 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUSC1-AS1Q66K80 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RUSC1-AS1Q66K80 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUSC1-AS1Q66K80 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUSC1-AS1Q66K80 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUSC1-AS1Q66K80 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUSC1-AS1Q66K80 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUSC1-AS1Q66K80 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUSC1-AS1Q66K80 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms