Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
IFFO2Q5TF58 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
IFFO2Q5TF58 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
IFFO2Q5TF58 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
IFFO2Q5TF58 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
IFFO2Q5TF58 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
IFFO2Q5TF58 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
IFFO2Q5TF58 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
IFFO2Q5TF58 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
IFFO2Q5TF58 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
IFFO2Q5TF58 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
IFFO2Q5TF58 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
IFFO2Q5TF58 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
IFFO2Q5TF58 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
IFFO2Q5TF58 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
IFFO2Q5TF58 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
IFFO2Q5TF58 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
IFFO2Q5TF58 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFFO2Q5TF58 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IFFO2Q5TF58 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
IFFO2Q5TF58 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
IFFO2Q5TF58 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
IFFO2Q5TF58 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
IFFO2Q5TF58 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
IFFO2Q5TF58 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
IFFO2Q5TF58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFFO2Q5TF58 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFFO2Q5TF58 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFFO2Q5TF58 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFFO2Q5TF58 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFFO2Q5TF58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFFO2Q5TF58 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFFO2Q5TF58 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFFO2Q5TF58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFFO2Q5TF58 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFFO2Q5TF58 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IFFO2Q5TF58 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
IFFO2Q5TF58 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IFFO2Q5TF58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IFFO2Q5TF58 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFFO2Q5TF58 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IFFO2Q5TF58 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFFO2Q5TF58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFFO2Q5TF58 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IFFO2Q5TF58 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFFO2Q5TF58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFFO2Q5TF58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFFO2Q5TF58 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFFO2Q5TF58 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFFO2Q5TF58 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFFO2Q5TF58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFFO2Q5TF58 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFFO2Q5TF58 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
IFFO2Q5TF58 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
IFFO2Q5TF58 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFFO2Q5TF58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
IFFO2Q5TF58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
IFFO2Q5TF58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
IFFO2Q5TF58 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
IFFO2Q5TF58 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFFO2Q5TF58 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFFO2Q5TF58 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFFO2Q5TF58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFFO2Q5TF58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFFO2Q5TF58 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFFO2Q5TF58 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFFO2Q5TF58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFFO2Q5TF58 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFFO2Q5TF58 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFFO2Q5TF58 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFFO2Q5TF58 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFFO2Q5TF58 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
IFFO2Q5TF58 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFFO2Q5TF58 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFFO2Q5TF58 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
IFFO2Q5TF58 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
IFFO2Q5TF58 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFFO2Q5TF58 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IFFO2Q5TF58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IFFO2Q5TF58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFFO2Q5TF58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFFO2Q5TF58 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFFO2Q5TF58 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFFO2Q5TF58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IFFO2Q5TF58 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IFFO2Q5TF58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFFO2Q5TF58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFFO2Q5TF58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFFO2Q5TF58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFFO2Q5TF58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms