Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI8

RABL3, Rab-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL3Q5HYI8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RABL3Q5HYI8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RABL3Q5HYI8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RABL3Q5HYI8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RABL3Q5HYI8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RABL3Q5HYI8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RABL3Q5HYI8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABL3Q5HYI8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RABL3Q5HYI8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RABL3Q5HYI8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABL3Q5HYI8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RABL3Q5HYI8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RABL3Q5HYI8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RABL3Q5HYI8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RABL3Q5HYI8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RABL3Q5HYI8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RABL3Q5HYI8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABL3Q5HYI8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RABL3Q5HYI8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RABL3Q5HYI8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RABL3Q5HYI8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RABL3Q5HYI8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABL3Q5HYI8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RABL3Q5HYI8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABL3Q5HYI8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABL3Q5HYI8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABL3Q5HYI8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABL3Q5HYI8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABL3Q5HYI8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABL3Q5HYI8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABL3Q5HYI8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABL3Q5HYI8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABL3Q5HYI8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABL3Q5HYI8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABL3Q5HYI8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABL3Q5HYI8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABL3Q5HYI8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABL3Q5HYI8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABL3Q5HYI8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABL3Q5HYI8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABL3Q5HYI8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABL3Q5HYI8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABL3Q5HYI8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABL3Q5HYI8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABL3Q5HYI8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABL3Q5HYI8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABL3Q5HYI8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABL3Q5HYI8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABL3Q5HYI8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABL3Q5HYI8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABL3Q5HYI8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABL3Q5HYI8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABL3Q5HYI8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL3Q5HYI8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABL3Q5HYI8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABL3Q5HYI8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABL3Q5HYI8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABL3Q5HYI8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABL3Q5HYI8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABL3Q5HYI8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABL3Q5HYI8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABL3Q5HYI8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABL3Q5HYI8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABL3Q5HYI8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABL3Q5HYI8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABL3Q5HYI8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABL3Q5HYI8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABL3Q5HYI8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABL3Q5HYI8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABL3Q5HYI8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RABL3Q5HYI8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABL3Q5HYI8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABL3Q5HYI8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABL3Q5HYI8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABL3Q5HYI8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABL3Q5HYI8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABL3Q5HYI8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABL3Q5HYI8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABL3Q5HYI8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABL3Q5HYI8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABL3Q5HYI8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABL3Q5HYI8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RABL3Q5HYI8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABL3Q5HYI8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABL3Q5HYI8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABL3Q5HYI8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABL3Q5HYI8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABL3Q5HYI8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms