Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
NCBP3Q53F19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NCBP3Q53F19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCBP3Q53F19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCBP3Q53F19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCBP3Q53F19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
NCBP3Q53F19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NCBP3Q53F19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NCBP3Q53F19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCBP3Q53F19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCBP3Q53F19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCBP3Q53F19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCBP3Q53F19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCBP3Q53F19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NCBP3Q53F19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCBP3Q53F19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCBP3Q53F19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCBP3Q53F19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCBP3Q53F19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NCBP3Q53F19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCBP3Q53F19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NCBP3Q53F19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NCBP3Q53F19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCBP3Q53F19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
NCBP3Q53F19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCBP3Q53F19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NCBP3Q53F19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NCBP3Q53F19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCBP3Q53F19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCBP3Q53F19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCBP3Q53F19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCBP3Q53F19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NCBP3Q53F19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCBP3Q53F19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCBP3Q53F19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCBP3Q53F19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCBP3Q53F19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCBP3Q53F19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCBP3Q53F19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCBP3Q53F19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCBP3Q53F19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCBP3Q53F19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCBP3Q53F19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCBP3Q53F19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCBP3Q53F19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCBP3Q53F19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCBP3Q53F19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms