Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MINDY4Q4G0A6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MINDY4Q4G0A6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MINDY4Q4G0A6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
MINDY4Q4G0A6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MINDY4Q4G0A6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MINDY4Q4G0A6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MINDY4Q4G0A6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MINDY4Q4G0A6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MINDY4Q4G0A6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MINDY4Q4G0A6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MINDY4Q4G0A6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MINDY4Q4G0A6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MINDY4Q4G0A6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MINDY4Q4G0A6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MINDY4Q4G0A6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MINDY4Q4G0A6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MINDY4Q4G0A6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MINDY4Q4G0A6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MINDY4Q4G0A6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MINDY4Q4G0A6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MINDY4Q4G0A6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MINDY4Q4G0A6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MINDY4Q4G0A6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MINDY4Q4G0A6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MINDY4Q4G0A6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MINDY4Q4G0A6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MINDY4Q4G0A6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MINDY4Q4G0A6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MINDY4Q4G0A6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MINDY4Q4G0A6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MINDY4Q4G0A6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MINDY4Q4G0A6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MINDY4Q4G0A6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MINDY4Q4G0A6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MINDY4Q4G0A6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4Q4G0A6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4Q4G0A6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4Q4G0A6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4Q4G0A6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4Q4G0A6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY4Q4G0A6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4Q4G0A6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4Q4G0A6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MINDY4Q4G0A6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MINDY4Q4G0A6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MINDY4Q4G0A6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MINDY4Q4G0A6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MINDY4Q4G0A6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MINDY4Q4G0A6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MINDY4Q4G0A6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MINDY4Q4G0A6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MINDY4Q4G0A6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MINDY4Q4G0A6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MINDY4Q4G0A6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MINDY4Q4G0A6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MINDY4Q4G0A6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MINDY4Q4G0A6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MINDY4Q4G0A6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MINDY4Q4G0A6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MINDY4Q4G0A6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4Q4G0A6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4Q4G0A6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4Q4G0A6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MINDY4Q4G0A6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MINDY4Q4G0A6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MINDY4Q4G0A6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MINDY4Q4G0A6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MINDY4Q4G0A6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MINDY4Q4G0A6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MINDY4Q4G0A6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MINDY4Q4G0A6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MINDY4Q4G0A6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MINDY4Q4G0A6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MINDY4Q4G0A6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MINDY4Q4G0A6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MINDY4Q4G0A6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MINDY4Q4G0A6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MINDY4Q4G0A6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MINDY4Q4G0A6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MINDY4Q4G0A6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MINDY4Q4G0A6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MINDY4Q4G0A6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MINDY4Q4G0A6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MINDY4Q4G0A6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MINDY4Q4G0A6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MINDY4Q4G0A6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MINDY4Q4G0A6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MINDY4Q4G0A6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MINDY4Q4G0A6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MINDY4Q4G0A6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MINDY4Q4G0A6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MINDY4Q4G0A6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MINDY4Q4G0A6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms