Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ9

DEFB110, Beta-defensin 110, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB110Q30KQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DEFB110Q30KQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DEFB110Q30KQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DEFB110Q30KQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DEFB110Q30KQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DEFB110Q30KQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
DEFB110Q30KQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DEFB110Q30KQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DEFB110Q30KQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DEFB110Q30KQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DEFB110Q30KQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DEFB110Q30KQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DEFB110Q30KQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DEFB110Q30KQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DEFB110Q30KQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DEFB110Q30KQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DEFB110Q30KQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DEFB110Q30KQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DEFB110Q30KQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DEFB110Q30KQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DEFB110Q30KQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DEFB110Q30KQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DEFB110Q30KQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DEFB110Q30KQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DEFB110Q30KQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DEFB110Q30KQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DEFB110Q30KQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DEFB110Q30KQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DEFB110Q30KQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DEFB110Q30KQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DEFB110Q30KQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DEFB110Q30KQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DEFB110Q30KQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DEFB110Q30KQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DEFB110Q30KQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DEFB110Q30KQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DEFB110Q30KQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DEFB110Q30KQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DEFB110Q30KQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DEFB110Q30KQ9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DEFB110Q30KQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEFB110Q30KQ9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DEFB110Q30KQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DEFB110Q30KQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DEFB110Q30KQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DEFB110Q30KQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DEFB110Q30KQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DEFB110Q30KQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DEFB110Q30KQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DEFB110Q30KQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEFB110Q30KQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEFB110Q30KQ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DEFB110Q30KQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DEFB110Q30KQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DEFB110Q30KQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DEFB110Q30KQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DEFB110Q30KQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB110Q30KQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB110Q30KQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DEFB110Q30KQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB110Q30KQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DEFB110Q30KQ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DEFB110Q30KQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DEFB110Q30KQ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DEFB110Q30KQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DEFB110Q30KQ9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DEFB110Q30KQ9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DEFB110Q30KQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DEFB110Q30KQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DEFB110Q30KQ9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DEFB110Q30KQ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEFB110Q30KQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DEFB110Q30KQ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DEFB110Q30KQ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DEFB110Q30KQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DEFB110Q30KQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DEFB110Q30KQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DEFB110Q30KQ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DEFB110Q30KQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEFB110Q30KQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEFB110Q30KQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DEFB110Q30KQ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEFB110Q30KQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEFB110Q30KQ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEFB110Q30KQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEFB110Q30KQ9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEFB110Q30KQ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEFB110Q30KQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEFB110Q30KQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms