Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PKN1Q16512 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PKN1Q16512 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
PKN1Q16512 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PKN1Q16512 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PKN1Q16512 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PKN1Q16512 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PKN1Q16512 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PKN1Q16512 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PKN1Q16512 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PKN1Q16512 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PKN1Q16512 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PKN1Q16512 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PKN1Q16512 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
PKN1Q16512 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKN1Q16512 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PKN1Q16512 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PKN1Q16512 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PKN1Q16512 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PKN1Q16512 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKN1Q16512 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKN1Q16512 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PKN1Q16512 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PKN1Q16512 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PKN1Q16512 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKN1Q16512 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKN1Q16512 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PKN1Q16512 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKN1Q16512 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PKN1Q16512 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PKN1Q16512 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKN1Q16512 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKN1Q16512 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PKN1Q16512 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PKN1Q16512 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PKN1Q16512 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PKN1Q16512 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PKN1Q16512 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PKN1Q16512 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PKN1Q16512 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PKN1Q16512 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PKN1Q16512 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PKN1Q16512 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PKN1Q16512 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKN1Q16512 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKN1Q16512 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKN1Q16512 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKN1Q16512 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKN1Q16512 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKN1Q16512 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PKN1Q16512 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PKN1Q16512 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKN1Q16512 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PKN1Q16512 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PKN1Q16512 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PKN1Q16512 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKN1Q16512 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKN1Q16512 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKN1Q16512 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PKN1Q16512 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKN1Q16512 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKN1Q16512 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKN1Q16512 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKN1Q16512 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKN1Q16512 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PKN1Q16512 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKN1Q16512 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKN1Q16512 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKN1Q16512 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKN1Q16512 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKN1Q16512 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PKN1Q16512 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKN1Q16512 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKN1Q16512 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PKN1Q16512 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PKN1Q16512 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKN1Q16512 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PKN1Q16512 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PKN1Q16512 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PKN1Q16512 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKN1Q16512 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKN1Q16512 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKN1Q16512 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PKN1Q16512 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PKN1Q16512 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
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