Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP3Q15836 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP3Q15836 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP3Q15836 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAMP3Q15836 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP3Q15836 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP3Q15836 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAMP3Q15836 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAMP3Q15836 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP3Q15836 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP3Q15836 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAMP3Q15836 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP3Q15836 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP3Q15836 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP3Q15836 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAMP3Q15836 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP3Q15836 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP3Q15836 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP3Q15836 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP3Q15836 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAMP3Q15836 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP3Q15836 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP3Q15836 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VAMP3Q15836 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP3Q15836 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP3Q15836 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAMP3Q15836 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAMP3Q15836 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP3Q15836 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP3Q15836 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP3Q15836 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP3Q15836 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP3Q15836 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP3Q15836 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP3Q15836 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAMP3Q15836 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP3Q15836 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP3Q15836 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP3Q15836 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP3Q15836 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP3Q15836 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP3Q15836 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAMP3Q15836 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP3Q15836 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP3Q15836 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP3Q15836 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAMP3Q15836 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP3Q15836 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP3Q15836 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP3Q15836 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP3Q15836 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP3Q15836 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAMP3Q15836 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP3Q15836 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP3Q15836 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP3Q15836 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP3Q15836 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP3Q15836 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VAMP3Q15836 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP3Q15836 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP3Q15836 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP3Q15836 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP3Q15836 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP3Q15836 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP3Q15836 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP3Q15836 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP3Q15836 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP3Q15836 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAMP3Q15836 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAMP3Q15836 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VAMP3Q15836 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VAMP3Q15836 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAMP3Q15836 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAMP3Q15836 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAMP3Q15836 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP3Q15836 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP3Q15836 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP3Q15836 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP3Q15836 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP3Q15836 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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