Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.26
ITSN1Q15811 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.37■■■■■ 5.17
ITSN1Q15811 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ITSN1Q15811 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.72■■■■■ 5.07
ITSN1Q15811 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
ITSN1Q15811 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
ITSN1Q15811 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ITSN1Q15811 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
ITSN1Q15811 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ITSN1Q15811 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ITSN1Q15811 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ITSN1Q15811 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ITSN1Q15811 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ITSN1Q15811 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ITSN1Q15811 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ITSN1Q15811 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ITSN1Q15811 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ITSN1Q15811 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ITSN1Q15811 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ITSN1Q15811 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ITSN1Q15811 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ITSN1Q15811 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ITSN1Q15811 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ITSN1Q15811 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ITSN1Q15811 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ITSN1Q15811 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ITSN1Q15811 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
ITSN1Q15811 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ITSN1Q15811 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ITSN1Q15811 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ITSN1Q15811 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ITSN1Q15811 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ITSN1Q15811 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ITSN1Q15811 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
ITSN1Q15811 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ITSN1Q15811 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ITSN1Q15811 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43■■■■■ 4.47
ITSN1Q15811 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
ITSN1Q15811 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ITSN1Q15811 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ITSN1Q15811 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ITSN1Q15811 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ITSN1Q15811 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ITSN1Q15811 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
ITSN1Q15811 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ITSN1Q15811 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ITSN1Q15811 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ITSN1Q15811 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ITSN1Q15811 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
ITSN1Q15811 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ITSN1Q15811 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ITSN1Q15811 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ITSN1Q15811 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITSN1Q15811 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITSN1Q15811 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ITSN1Q15811 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
ITSN1Q15811 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ITSN1Q15811 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ITSN1Q15811 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ITSN1Q15811 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ITSN1Q15811 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ITSN1Q15811 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN1Q15811 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ITSN1Q15811 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ITSN1Q15811 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ITSN1Q15811 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ITSN1Q15811 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ITSN1Q15811 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ITSN1Q15811 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ITSN1Q15811 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ITSN1Q15811 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ITSN1Q15811 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ITSN1Q15811 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ITSN1Q15811 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN1Q15811 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ITSN1Q15811 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ITSN1Q15811 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN1Q15811 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ITSN1Q15811 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ITSN1Q15811 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ITSN1Q15811 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ITSN1Q15811 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ITSN1Q15811 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ITSN1Q15811 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ITSN1Q15811 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ITSN1Q15811 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
ITSN1Q15811 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN1Q15811 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ITSN1Q15811 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ITSN1Q15811 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ITSN1Q15811 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ITSN1Q15811 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ITSN1Q15811 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ITSN1Q15811 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ITSN1Q15811 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms