Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TAF1AQ15573 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TAF1AQ15573 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TAF1AQ15573 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TAF1AQ15573 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TAF1AQ15573 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TAF1AQ15573 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TAF1AQ15573 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TAF1AQ15573 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TAF1AQ15573 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1AQ15573 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TAF1AQ15573 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TAF1AQ15573 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TAF1AQ15573 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TAF1AQ15573 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TAF1AQ15573 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TAF1AQ15573 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TAF1AQ15573 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TAF1AQ15573 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TAF1AQ15573 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TAF1AQ15573 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TAF1AQ15573 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TAF1AQ15573 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TAF1AQ15573 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TAF1AQ15573 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TAF1AQ15573 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TAF1AQ15573 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TAF1AQ15573 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TAF1AQ15573 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TAF1AQ15573 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TAF1AQ15573 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TAF1AQ15573 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TAF1AQ15573 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TAF1AQ15573 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TAF1AQ15573 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TAF1AQ15573 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TAF1AQ15573 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TAF1AQ15573 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TAF1AQ15573 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1AQ15573 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1AQ15573 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1AQ15573 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1AQ15573 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1AQ15573 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1AQ15573 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1AQ15573 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1AQ15573 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1AQ15573 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TAF1AQ15573 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TAF1AQ15573 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TAF1AQ15573 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TAF1AQ15573 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TAF1AQ15573 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TAF1AQ15573 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TAF1AQ15573 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1AQ15573 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TAF1AQ15573 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1AQ15573 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1AQ15573 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1AQ15573 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1AQ15573 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1AQ15573 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1AQ15573 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1AQ15573 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1AQ15573 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1AQ15573 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1AQ15573 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1AQ15573 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1AQ15573 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1AQ15573 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1AQ15573 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1AQ15573 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1AQ15573 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1AQ15573 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1AQ15573 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1AQ15573 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1AQ15573 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1AQ15573 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1AQ15573 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1AQ15573 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1AQ15573 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1AQ15573 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1AQ15573 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1AQ15573 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1AQ15573 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1AQ15573 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1AQ15573 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1AQ15573 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1AQ15573 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1AQ15573 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1AQ15573 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1AQ15573 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1AQ15573 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1AQ15573 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1AQ15573 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1AQ15573 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF1AQ15573 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAF1AQ15573 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1AQ15573 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms