Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDGFRLQ15198 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDGFRLQ15198 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDGFRLQ15198 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFRLQ15198 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDGFRLQ15198 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDGFRLQ15198 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDGFRLQ15198 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PDGFRLQ15198 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PDGFRLQ15198 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDGFRLQ15198 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDGFRLQ15198 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PDGFRLQ15198 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PDGFRLQ15198 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PDGFRLQ15198 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PDGFRLQ15198 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PDGFRLQ15198 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PDGFRLQ15198 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PDGFRLQ15198 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PDGFRLQ15198 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDGFRLQ15198 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDGFRLQ15198 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDGFRLQ15198 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDGFRLQ15198 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDGFRLQ15198 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDGFRLQ15198 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFRLQ15198 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDGFRLQ15198 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDGFRLQ15198 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDGFRLQ15198 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDGFRLQ15198 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDGFRLQ15198 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDGFRLQ15198 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDGFRLQ15198 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PDGFRLQ15198 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PDGFRLQ15198 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDGFRLQ15198 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDGFRLQ15198 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDGFRLQ15198 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDGFRLQ15198 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PDGFRLQ15198 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PDGFRLQ15198 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PDGFRLQ15198 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDGFRLQ15198 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDGFRLQ15198 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDGFRLQ15198 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDGFRLQ15198 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDGFRLQ15198 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDGFRLQ15198 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDGFRLQ15198 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDGFRLQ15198 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDGFRLQ15198 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDGFRLQ15198 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PDGFRLQ15198 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDGFRLQ15198 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDGFRLQ15198 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDGFRLQ15198 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDGFRLQ15198 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDGFRLQ15198 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDGFRLQ15198 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PDGFRLQ15198 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDGFRLQ15198 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDGFRLQ15198 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDGFRLQ15198 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDGFRLQ15198 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDGFRLQ15198 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDGFRLQ15198 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDGFRLQ15198 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDGFRLQ15198 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDGFRLQ15198 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFRLQ15198 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDGFRLQ15198 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDGFRLQ15198 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDGFRLQ15198 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDGFRLQ15198 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDGFRLQ15198 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDGFRLQ15198 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDGFRLQ15198 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDGFRLQ15198 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDGFRLQ15198 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PDGFRLQ15198 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDGFRLQ15198 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
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