Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
R3HDM1Q15032 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
R3HDM1Q15032 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
R3HDM1Q15032 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
R3HDM1Q15032 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
R3HDM1Q15032 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
R3HDM1Q15032 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
R3HDM1Q15032 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
R3HDM1Q15032 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
R3HDM1Q15032 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
R3HDM1Q15032 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
R3HDM1Q15032 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
R3HDM1Q15032 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
R3HDM1Q15032 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
R3HDM1Q15032 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
R3HDM1Q15032 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
R3HDM1Q15032 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
R3HDM1Q15032 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
R3HDM1Q15032 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
R3HDM1Q15032 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
R3HDM1Q15032 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
R3HDM1Q15032 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
R3HDM1Q15032 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
R3HDM1Q15032 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
R3HDM1Q15032 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
R3HDM1Q15032 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
R3HDM1Q15032 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
R3HDM1Q15032 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
R3HDM1Q15032 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
R3HDM1Q15032 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
R3HDM1Q15032 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
R3HDM1Q15032 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
R3HDM1Q15032 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
R3HDM1Q15032 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
R3HDM1Q15032 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
R3HDM1Q15032 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
R3HDM1Q15032 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
R3HDM1Q15032 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
R3HDM1Q15032 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
R3HDM1Q15032 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
R3HDM1Q15032 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
R3HDM1Q15032 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
R3HDM1Q15032 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
R3HDM1Q15032 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
R3HDM1Q15032 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
R3HDM1Q15032 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
R3HDM1Q15032 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
R3HDM1Q15032 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
R3HDM1Q15032 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
R3HDM1Q15032 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
R3HDM1Q15032 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
R3HDM1Q15032 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
R3HDM1Q15032 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
R3HDM1Q15032 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
R3HDM1Q15032 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
R3HDM1Q15032 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
R3HDM1Q15032 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
R3HDM1Q15032 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
R3HDM1Q15032 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
R3HDM1Q15032 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
R3HDM1Q15032 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
R3HDM1Q15032 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
R3HDM1Q15032 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
R3HDM1Q15032 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
R3HDM1Q15032 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
R3HDM1Q15032 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
R3HDM1Q15032 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
R3HDM1Q15032 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
R3HDM1Q15032 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
R3HDM1Q15032 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
R3HDM1Q15032 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
R3HDM1Q15032 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
R3HDM1Q15032 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
R3HDM1Q15032 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
R3HDM1Q15032 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
R3HDM1Q15032 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
R3HDM1Q15032 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
R3HDM1Q15032 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
R3HDM1Q15032 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
R3HDM1Q15032 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
R3HDM1Q15032 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
R3HDM1Q15032 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
R3HDM1Q15032 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
R3HDM1Q15032 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
R3HDM1Q15032 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
R3HDM1Q15032 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
R3HDM1Q15032 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
R3HDM1Q15032 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
R3HDM1Q15032 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
R3HDM1Q15032 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
R3HDM1Q15032 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
R3HDM1Q15032 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
R3HDM1Q15032 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
R3HDM1Q15032 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
R3HDM1Q15032 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
R3HDM1Q15032 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
R3HDM1Q15032 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
R3HDM1Q15032 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
R3HDM1Q15032 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
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