Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TNIP1Q15025 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
TNIP1Q15025 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TNIP1Q15025 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TNIP1Q15025 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TNIP1Q15025 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIP1Q15025 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNIP1Q15025 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIP1Q15025 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIP1Q15025 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
TNIP1Q15025 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TNIP1Q15025 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TNIP1Q15025 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIP1Q15025 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNIP1Q15025 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNIP1Q15025 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TNIP1Q15025 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TNIP1Q15025 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TNIP1Q15025 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNIP1Q15025 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIP1Q15025 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNIP1Q15025 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TNIP1Q15025 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TNIP1Q15025 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TNIP1Q15025 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TNIP1Q15025 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TNIP1Q15025 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TNIP1Q15025 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNIP1Q15025 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNIP1Q15025 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIP1Q15025 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIP1Q15025 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
TNIP1Q15025 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TNIP1Q15025 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNIP1Q15025 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TNIP1Q15025 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TNIP1Q15025 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TNIP1Q15025 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIP1Q15025 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIP1Q15025 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIP1Q15025 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIP1Q15025 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNIP1Q15025 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNIP1Q15025 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
TNIP1Q15025 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNIP1Q15025 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TNIP1Q15025 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNIP1Q15025 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIP1Q15025 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNIP1Q15025 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNIP1Q15025 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TNIP1Q15025 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TNIP1Q15025 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNIP1Q15025 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNIP1Q15025 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIP1Q15025 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNIP1Q15025 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIP1Q15025 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNIP1Q15025 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNIP1Q15025 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIP1Q15025 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNIP1Q15025 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNIP1Q15025 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNIP1Q15025 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNIP1Q15025 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNIP1Q15025 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNIP1Q15025 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TNIP1Q15025 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNIP1Q15025 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIP1Q15025 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIP1Q15025 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNIP1Q15025 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNIP1Q15025 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNIP1Q15025 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNIP1Q15025 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNIP1Q15025 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNIP1Q15025 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNIP1Q15025 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIP1Q15025 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIP1Q15025 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIP1Q15025 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIP1Q15025 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIP1Q15025 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNIP1Q15025 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNIP1Q15025 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TNIP1Q15025 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIP1Q15025 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIP1Q15025 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIP1Q15025 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIP1Q15025 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
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