Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
BECN1Q14457 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
BECN1Q14457 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BECN1Q14457 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
BECN1Q14457 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
BECN1Q14457 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
BECN1Q14457 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
BECN1Q14457 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
BECN1Q14457 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
BECN1Q14457 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
BECN1Q14457 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
BECN1Q14457 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BECN1Q14457 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
BECN1Q14457 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
BECN1Q14457 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
BECN1Q14457 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BECN1Q14457 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
BECN1Q14457 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BECN1Q14457 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
BECN1Q14457 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
BECN1Q14457 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BECN1Q14457 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BECN1Q14457 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BECN1Q14457 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
BECN1Q14457 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BECN1Q14457 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BECN1Q14457 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BECN1Q14457 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BECN1Q14457 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BECN1Q14457 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BECN1Q14457 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BECN1Q14457 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BECN1Q14457 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BECN1Q14457 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BECN1Q14457 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BECN1Q14457 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
BECN1Q14457 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BECN1Q14457 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BECN1Q14457 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BECN1Q14457 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BECN1Q14457 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BECN1Q14457 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BECN1Q14457 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BECN1Q14457 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BECN1Q14457 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
BECN1Q14457 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BECN1Q14457 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BECN1Q14457 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BECN1Q14457 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BECN1Q14457 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BECN1Q14457 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BECN1Q14457 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BECN1Q14457 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BECN1Q14457 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BECN1Q14457 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BECN1Q14457 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BECN1Q14457 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BECN1Q14457 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BECN1Q14457 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BECN1Q14457 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BECN1Q14457 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
BECN1Q14457 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BECN1Q14457 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
BECN1Q14457 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BECN1Q14457 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BECN1Q14457 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BECN1Q14457 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BECN1Q14457 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BECN1Q14457 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BECN1Q14457 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BECN1Q14457 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BECN1Q14457 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
BECN1Q14457 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BECN1Q14457 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BECN1Q14457 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BECN1Q14457 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BECN1Q14457 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BECN1Q14457 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
BECN1Q14457 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BECN1Q14457 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BECN1Q14457 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BECN1Q14457 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BECN1Q14457 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BECN1Q14457 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BECN1Q14457 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BECN1Q14457 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BECN1Q14457 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
BECN1Q14457 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
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