Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CAPRIN1Q14444 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CAPRIN1Q14444 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CAPRIN1Q14444 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CAPRIN1Q14444 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAPRIN1Q14444 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAPRIN1Q14444 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CAPRIN1Q14444 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAPRIN1Q14444 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPRIN1Q14444 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPRIN1Q14444 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPRIN1Q14444 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPRIN1Q14444 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPRIN1Q14444 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPRIN1Q14444 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CAPRIN1Q14444 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPRIN1Q14444 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPRIN1Q14444 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAPRIN1Q14444 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAPRIN1Q14444 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAPRIN1Q14444 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAPRIN1Q14444 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPRIN1Q14444 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPRIN1Q14444 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPRIN1Q14444 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPRIN1Q14444 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPRIN1Q14444 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPRIN1Q14444 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPRIN1Q14444 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPRIN1Q14444 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPRIN1Q14444 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPRIN1Q14444 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPRIN1Q14444 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPRIN1Q14444 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPRIN1Q14444 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPRIN1Q14444 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPRIN1Q14444 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPRIN1Q14444 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPRIN1Q14444 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPRIN1Q14444 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPRIN1Q14444 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPRIN1Q14444 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPRIN1Q14444 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPRIN1Q14444 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPRIN1Q14444 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPRIN1Q14444 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPRIN1Q14444 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPRIN1Q14444 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPRIN1Q14444 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPRIN1Q14444 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPRIN1Q14444 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPRIN1Q14444 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPRIN1Q14444 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPRIN1Q14444 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPRIN1Q14444 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPRIN1Q14444 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPRIN1Q14444 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPRIN1Q14444 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAPRIN1Q14444 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPRIN1Q14444 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPRIN1Q14444 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPRIN1Q14444 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPRIN1Q14444 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPRIN1Q14444 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPRIN1Q14444 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPRIN1Q14444 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPRIN1Q14444 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPRIN1Q14444 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPRIN1Q14444 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPRIN1Q14444 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPRIN1Q14444 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPRIN1Q14444 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPRIN1Q14444 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPRIN1Q14444 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPRIN1Q14444 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPRIN1Q14444 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPRIN1Q14444 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPRIN1Q14444 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPRIN1Q14444 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPRIN1Q14444 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPRIN1Q14444 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPRIN1Q14444 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPRIN1Q14444 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPRIN1Q14444 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPRIN1Q14444 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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