Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.75■■■■■ 5.07
CNGB1Q14028 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
CNGB1Q14028 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
CNGB1Q14028 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CNGB1Q14028 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CNGB1Q14028 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CNGB1Q14028 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CNGB1Q14028 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CNGB1Q14028 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CNGB1Q14028 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CNGB1Q14028 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CNGB1Q14028 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CNGB1Q14028 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CNGB1Q14028 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CNGB1Q14028 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CNGB1Q14028 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CNGB1Q14028 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CNGB1Q14028 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CNGB1Q14028 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CNGB1Q14028 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CNGB1Q14028 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CNGB1Q14028 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CNGB1Q14028 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CNGB1Q14028 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CNGB1Q14028 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CNGB1Q14028 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CNGB1Q14028 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CNGB1Q14028 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CNGB1Q14028 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CNGB1Q14028 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CNGB1Q14028 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CNGB1Q14028 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CNGB1Q14028 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CNGB1Q14028 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CNGB1Q14028 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CNGB1Q14028 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CNGB1Q14028 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CNGB1Q14028 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CNGB1Q14028 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CNGB1Q14028 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CNGB1Q14028 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CNGB1Q14028 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CNGB1Q14028 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CNGB1Q14028 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CNGB1Q14028 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CNGB1Q14028 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CNGB1Q14028 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CNGB1Q14028 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CNGB1Q14028 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CNGB1Q14028 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CNGB1Q14028 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CNGB1Q14028 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CNGB1Q14028 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CNGB1Q14028 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CNGB1Q14028 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CNGB1Q14028 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CNGB1Q14028 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CNGB1Q14028 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CNGB1Q14028 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CNGB1Q14028 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CNGB1Q14028 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNGB1Q14028 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CNGB1Q14028 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CNGB1Q14028 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNGB1Q14028 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNGB1Q14028 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CNGB1Q14028 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CNGB1Q14028 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CNGB1Q14028 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CNGB1Q14028 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CNGB1Q14028 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CNGB1Q14028 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CNGB1Q14028 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CNGB1Q14028 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CNGB1Q14028 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNGB1Q14028 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CNGB1Q14028 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CNGB1Q14028 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CNGB1Q14028 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CNGB1Q14028 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CNGB1Q14028 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CNGB1Q14028 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CNGB1Q14028 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CNGB1Q14028 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CNGB1Q14028 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CNGB1Q14028 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CNGB1Q14028 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CNGB1Q14028 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CNGB1Q14028 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CNGB1Q14028 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CNGB1Q14028 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CNGB1Q14028 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CNGB1Q14028 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CNGB1Q14028 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
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