Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA4Q13772 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA4Q13772 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA4Q13772 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCOA4Q13772 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NCOA4Q13772 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NCOA4Q13772 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NCOA4Q13772 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA4Q13772 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA4Q13772 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA4Q13772 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA4Q13772 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA4Q13772 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA4Q13772 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA4Q13772 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA4Q13772 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA4Q13772 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NCOA4Q13772 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NCOA4Q13772 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NCOA4Q13772 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA4Q13772 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NCOA4Q13772 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCOA4Q13772 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA4Q13772 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA4Q13772 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA4Q13772 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA4Q13772 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA4Q13772 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA4Q13772 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA4Q13772 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA4Q13772 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA4Q13772 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA4Q13772 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA4Q13772 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA4Q13772 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NCOA4Q13772 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NCOA4Q13772 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA4Q13772 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCOA4Q13772 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCOA4Q13772 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NCOA4Q13772 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NCOA4Q13772 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NCOA4Q13772 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA4Q13772 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA4Q13772 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCOA4Q13772 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NCOA4Q13772 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCOA4Q13772 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCOA4Q13772 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
NCOA4Q13772 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCOA4Q13772 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCOA4Q13772 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA4Q13772 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA4Q13772 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA4Q13772 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCOA4Q13772 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCOA4Q13772 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCOA4Q13772 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCOA4Q13772 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCOA4Q13772 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NCOA4Q13772 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NCOA4Q13772 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCOA4Q13772 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCOA4Q13772 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCOA4Q13772 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCOA4Q13772 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCOA4Q13772 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCOA4Q13772 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCOA4Q13772 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA4Q13772 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NCOA4Q13772 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA4Q13772 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA4Q13772 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA4Q13772 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA4Q13772 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA4Q13772 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA4Q13772 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NCOA4Q13772 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCOA4Q13772 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCOA4Q13772 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NCOA4Q13772 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NCOA4Q13772 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA4Q13772 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA4Q13772 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCOA4Q13772 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA4Q13772 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA4Q13772 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA4Q13772 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA4Q13772 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA4Q13772 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA4Q13772 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA4Q13772 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA4Q13772 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA4Q13772 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCOA4Q13772 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
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